基于m6A和m5C相关lncRNA的胰腺导管腺癌预后模型及其与免疫微环境的关系

摘要

背景与目的：胰腺导管腺癌（PDAC）是一种恶性程度高、预后极差的消化系统肿瘤，其早期诊断和治疗仍面临巨大挑战。近年来，RNA甲基化修饰[如N6-甲基腺苷（m6A）和5-甲基胞嘧啶（m5C）]在肿瘤发生发展中的作用备受关注，但其在PDAC中的调控机制及临床应用价值尚不明确。本研究旨在筛选与m6A和m5C关联的PDAC预后相关lncRNA，构建可靠的预后预测模型，并探讨其与肿瘤免疫微环境的关系。方法：基于TCGA-PDAC队列的RNA-seq数据，通过差异表达分析和Pearson相关性分析鉴定m6A和m5C相关差异表达lncRNA (DElncRNA)。将样本随机分为训练集（n=89）和验证集（n=89）。采用LASSOCox回归筛选关键DElncRNA并构建预后模型，根据风险评分将患者分为高、低风险组。通过KaplanMeier生存分析、受试者工作特征曲线（ROC）及多因素Cox回归评估模型的预测效能。进一步结合CIBERSORT算法和ESTIMATE评分分析高、低风险组患者的免疫细胞浸润特征及肿瘤微环境（TME）差异。结果：研究筛选出4个m6A和m5C相关DElncRNA (LINC00857、LINC02038、TSPOAP1-AS1、TRPC7-AS1)构建预后模型。高风险组患者总体生存率显著低于低风险组（P<0.05），且风险评分是PDAC预后的独立预测因素（HR=1.551,95%CI=1.297～1.854,P<0.001）。ROC曲线分析结果显示，风险评分模型在训练集和验证集中均显示高预测效能（1、3、5年曲线下面积分别为0.766、0.875、0.879;0.685、0.711、0.792）。免疫分析显示，高风险组M0巨噬细胞浸润增加，TME评分降低（均P<0.05），提示免疫抑制性微环境特征。结论：本研究成功构建了基于m6A和m5C相关DElncRNA的PDAC预后模型，证实其具有独立预测价值；高风险患者呈现M0巨噬细胞富集及免疫抑制性微环境特征，可能为不良预后的潜在机制。

关键词

胰腺肿瘤 / 甲基化 / 肿瘤微环境 / 预后模型