LncRNA-miRNA-mRNA网络分析揭示TDRG1在低级别胶质瘤对癌症进展的促进作用

摘要

目的：探讨竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络是否与低级别胶质瘤（LGG）的进展风险相关，并寻找如TDRG1等潜在的长链非编码RNA(lncRNA)分子标记用于LGG的作用研究和评估。方法：使用美国癌症基因组图谱（TCGA）数据库中的530个样本、中国脑胶质瘤基因组图谱（CGGA）的198个样本以及广西医科大学附属肿瘤医院的3个样本的转录组学、基因组学以及临床数据和实验验证，全面分析LGG进展患者的显著差异表达基因（DEGs）。根据DEGs构建lncRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)网络，通过生物信息学方法对候选lncRNA进行功能分析。利用病毒构建高精度C57BL/6J小鼠胶质瘤模型进行体内功能验证。结果：共定出35个LGG进展相关差异基因，功能富集于信号肽和免疫通路。差异表达指数与IDH1、TP53、PTEN、EGFR、CDKN2A突变显著关联（P<0.05）。ceRNA网络分析揭示TDRG1等lncRNA靶向miR-30、miR-513调控胶质瘤进展。生存分析显示miR-30、miR-1254、TDRG1表达上调显著缩短生存期（P<0.05）。RNA测序与qPCR证实TDRG1在LGG中特异性高表达（P<0.05），小鼠模型中TDRG1显著促进胶质瘤生长（P<0.05），表明其在LGG进展中的核心作用。结论：TDRG1与LGG的进展密切相关，值得进一步探索其在LGG中的功能及临床应用价值。

关键词

低级别胶质瘤 / 长链非编码RNA / 竞争性内源性RNA网络 / TDRG1 / 生物标志物