基于生物信息学方法分析L1CAM在肺鳞状细胞癌中的表达及意义

摘要

目的：分析细胞黏附分子Ll基因(L1CAM)在肺鳞状细胞癌中的表达，并探讨其潜在的生物学意义。方法：利用Ualcan数据库分析肺鳞状细胞癌(LUSC)肿瘤组织及正常组织L1CAM表达，并在正常细胞系和肿瘤细胞系中进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证；采用Sangerbox3.0分析L1CAM表达与LUSC患者预后的关系；通过LinkedOmics检索L1CAM共表达基因，将获取的基因集进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析；利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。结果：与正常肺组织比较，LUSC组织中L1CAM表达水平明显升高；经qPCR实验验证，与正常肺上皮细胞相比，LUSC细胞系中的L1CAM表达量显著升高；L1CAM共表达基因主要富集的生物学过程包括细胞发育、细胞或亚细胞成分的运动、细胞内信号转导等；主要富集的细胞组分包括细胞外基质、内质网腔、线粒体膜等；主要参与的生物学功能包括信号受体结合、钙离子结合、细胞外基质结构成分等；KEGG信号通路主要与黏着斑、ECM受体互作、顺铂耐药性等相关；L1CAM高表达患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无病间期(DFI)、无进展间期(PFI)明显低于低表达患者，预示高表达L1CAM的不良预后；PPI网络显示L1CAM蛋白与EGFR、NCAM1、ANK1-3等存在互作关系。结论：L1CAM在LUSC组织中高表达，可作为预后指标；该基因的表达参与多种生物学功能，因此有望成为肺鳞癌潜在的生物标志物。

关键词

肺鳞状细胞癌 / 细胞黏附分子Ll / 生物信息学分析