LAMP5基因在食管癌中的预后作用及免疫分析

摘要

目的：探讨LAMP5在食管癌中的预后作用和潜在免疫功能。方法：从TCGA和GTEx数据库获取181例食管癌肿瘤组织转录组数据和668例正常组织转录组数据，使用在线工具分析LAMP5在食管癌肿瘤样本和正常样本及临床各分期中的表达情况。使用limma软件包鉴定食管癌组织和正常组织的差异表达基因，并进行KEGG通路富集和GO功能富集分析。绘制Kaplan-Meier生存曲线，采用logrank检验和单变量Cox回归分析LAMP5表达与患者生存率的相关性。通过QUANTISEQ算法分别计算LAMP5表达与免疫细胞浸润的相关性以及与免疫检查点基因表达的相关性。结果：LAMP5在食管癌样本中高表达，在正常样本中低表达(P<0.001);LAMP5的表达在临床分期前3期中呈逐步增长的趋势(P<0.01);筛选出4896个差异表达基因，包括2861个上调基因以及2035个下调基因，通路富集分析结果显示，上调基因显著富集在细胞因子-细胞因子受体的相互作用、细胞周期等信号通路，下调基因显著富集在钙信号等通路；KM生存曲线结果表明低表达组患者的生存时间显著高于高表达组患者的生存时间；Cox回归模型风险比值结果表明LAMP5是食管癌的危险性因素；LAMP5的表达与Tregs、M2巨噬细胞等免疫细胞的浸润呈显著正相关，与7个免疫检查点基因的表达呈显著正相关。结论：LAMP5的表达与食管癌的预后密切相关，它在肿瘤微环境和抑制抗肿瘤免疫功能中发挥显著作用；LAMP5有望成为一种新型的食管癌诊断标志物，同时LAMP5在靶向免疫治疗药物开发中具有重要价值。

关键词

LAMP5 / 食管癌 / 预后 / 免疫分析 / 肿瘤微环境

基金资助

2023年度山西省大学生创新创业训练计划项目(20230876); 2023年山西省科技创新项目(2023L204)