口腔鳞状细胞癌与干燥综合征的交叉免疫基因预测分析

摘要

目的 通过生物信息学法筛选口腔鳞状细胞癌（oral squamous cell carcinoma, OSCC）与干燥综合征（Sjogren's syndrome, SS）在转录水平的交叉免疫基因（cross immune genes, CIGs）并分析免疫浸润状态，为OSCC在SS患者中的诊断和治疗提供科学依据。方法 从GEO数据库下载OSCC和SS数据集，使用limma R软件包结合Venn图筛选OSCC和SS中的差异表达基因（differentially expressed genes, DEGs）,再与免疫基因数据集进行交叉筛选获得CIGs。采用最小绝对收缩和选择算子（least absolute shrinkage and selection operator, LASSO）回归算法筛选核心CIGs。利用CIBERSORT R软件包分析浸润的免疫细胞类型及比例。结果 从OSCC数据集中筛选出2 885个DEGs,从SS数据集中筛选出2 472个DEGs,交叉分析得到55个CIGs;经LASSO回归分析后二次交叉筛选出RASGRP3为潜在的核心CIGs,在OSCC和SS中表达均上调。另外，在OSCC和SS中，记忆CD4⁺T细胞、巨噬细胞和活化自然杀伤（natural killer, NK）细胞浸润均与RASGRP3相关。结论 癌基因RASGRP3可作为OSCC和SS的潜在治疗靶点，并对二者的诊断具有参考价值；RASGRP3与浸润的NK细胞、巨噬细胞、CD4⁺T细胞等密切相关，为探索针对SS患者OSCC的免疫治疗策略提供新思路。

关键词

口腔鳞状细胞癌 / 干燥综合征 / 核心交叉免疫基因 / 免疫细胞 / 免疫浸润 / 生物信息学分析