基于转录组数据分析M2巨噬细胞在胶质瘤免疫微环境中的分子特征

摘要

目的 基于CGGA及TCGA数据库中的转录组数据，分析M2巨噬细胞在胶质瘤免疫微环境中的分子特征，为在胶质瘤中的免疫治疗提供新思路。方法 通过“xCELL”R包计算每位患者免疫浸润细胞得分，并分析M2巨噬细胞与临床特征间的联系。利用Kaplan-Meier、ROC曲线及COX回归分析评估M2型巨噬细胞作为临床预后指标的潜力。此外，应用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)及基因集富集分析(GSEA)来揭示M2型巨噬细胞在肿瘤免疫微环境中的功能。最后，利用Cytohubba中6种算法识别关键基因，并分析M2巨噬细胞与免疫调节位点的相关性。结果 M2型巨噬细胞倾向于在恶性程度更高的胶质瘤中富集，且其富集程度与患者的预后成负相关。在免疫微环境中，M2型巨噬细胞主要积极参与炎症反应调控等生物学过程。ITGB2、LAPTM5、TYROBP被确认为M2型巨噬细胞的关键Hub基因。同时，M2型巨噬细胞还与若干免疫检查点呈现显著相关性。结论 M2型巨噬细胞可作为胶质瘤不良预后的生物标志物，并能够通过调控免疫反应促进肿瘤发展。ITGB2、LAPTM5和TYROBP被鉴定为M2型巨噬细胞的关键位点，为胶质瘤免疫治疗提供潜在的新靶标。

关键词

胶质瘤 / M2巨噬细胞 / 功能富集 / 免疫检查点

基金资助

黑龙江省中医药管理局中医药科研课题项目(ZHY2023-098)