趋化素样因子超家族成员在胰腺癌中的表达和临床意义

摘要

目的 应用生物信息学的方法探讨趋化素样因子超家族成员(chemokine-like factor-like MARVEL transmembrane domain containing member/chemokine-like factor superfamily member, CMTM/CKLFSF,CMTM)在胰腺癌中异常表达的临床病理特征，并分析相关基因共表达的意义。方法 通过GEPIA2、HPA和Kaplan-Meier plotter数据库分析CMTM家族成员在胰腺癌中的表达和预后价值。通过TISIDB、STRING、cBioPortal和DAVID数据库确定CMTM家族成员的免疫浸润和生物学功能。结果 CMTM1、CMTM3、CMTM6和CMTM7在胰腺癌中的mRNA水平显著高于正常组织。CMTM1、CMTM2、CMTM3、CMTM4、CMTM6和CMTM7与胰腺癌的总生存期相关(P<0.05)。CMTM4的高表达预示较好的预后，而CMTM1、CMTM2、CMTM3、CMTM6和CMTM7的高表达则为不良预后因素。此外，CMTM1、CMTM3、CMTM6和CMTM7与无病生存期(RFS)呈负相关，与临床分级呈正相关。进一步分析发现，CMTM1、CMTM6和CMTM7与肿瘤微环境中发挥重要作用的Tcm CD4细胞和CD160显著相关。GO富集分析表明，CMTM1、CMTM6和CMTM7的功能主要集中在蛋白质结合、细胞间粘附和细胞分裂等。此外，CMTM1和CMTM6主要通过调控细胞周期、Hippo信号通路、PI3K-Akt信号通路、ERBB信号通路、p53信号通路、MAPK信号通路等调节肿瘤生物学行为。而CMTM7主要通过核糖体、蛋白酶体、剪接体、细胞周期和p53信号通路调控胰腺癌的生物学行为。PPI网络分析显示，EGFR、KRAS和CTNNB1在胰腺癌中发挥核心作用。结论 CMTM家族基因，尤其是CMTM1、CMTM6、CMTM7的表达水平可能作为胰腺癌的预后生物标志物。CMTM1、CMTM6和CMTM7可能在肿瘤微环境中发挥关键作用。

关键词

CMTM / 胰腺癌 / 肿瘤微环境 / 生物信息学 / 预后分析