基于多重病原体PCR的靶向基因组测序在恶性肿瘤患者下呼吸道感染诊断中的临床应用

摘要

目的 研究基于多重病原体PCR的靶向基因组测序技术辅助诊断恶性肿瘤患者下呼吸道感染的可行性。方法 应用基于多重病原体PCR的靶向基因组测序(tNGS)和临床常规微生物培养(培养法)分别检测疑似呼吸道感染的恶性肿瘤患者的痰液或肺泡灌洗液，比较tNGS和培养法病原体鉴定结果及其与患者临床诊疗的符合度。结果 在198例患者中，tNGS和培养法检测均阳性45例(22.7%),均阴性62例(31.3%),tNGS阴性但培养法阳性5例(2.5%),而tNGS阳性但培养法阴性86例(43.4%),tNGS阳性病例中有24例指导临床更换抗菌药物，35例指导临床更换抗病毒治疗，并取得了明显的治疗效果。tNGS和培养法的总检出率分别为66.2%和25.2%,差异具有统计学意义(P<0.05);tNGS病原体的检出率明显高于培养法。tNGS对细菌、病毒、结核分枝杆菌、真菌及支原体的检出率分别为53.6%、89.4%、2.4%、46.9%和0.48%,均显著高于培养法(细菌及真菌检出率为11.1%和3.19%,其余病原体未检出)。此外，tNGS与患者临床诊疗的符合度为97.5%,明显高于培养法的56.6%(P<0.05)。结论 基于多重病原体PCR的靶向基因组测序(tNGS)技术在恶性肿瘤患者下呼吸道感染的病原体鉴定中具有显著优势。tNGS技术在病原体鉴定方面具有更广泛的覆盖范围和更短的报告时间，但其结果仍需临床医师的仔细分析和解读。建议在临床实践中将tNGS与传统培养法结合使用，以提高下呼吸道感染的诊断准确性和治疗效果。

关键词

靶向基因组测序 / 微生物培养法 / 诊疗符合度