共携带碳青霉烯酶基因bla_NDM-5、bla_VIM-1和bla_KPC-2肺炎克雷伯菌临床株K27的基因组特征

摘要

目的 分析碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌临床株K27的基因组和携带的质粒的特征。方法 通过VITEK 2 Compact系统（法国梅里埃）测定抗菌药物敏感性。使用S1核酸酶脉冲场凝胶电泳（S1-PFGE）估计质粒大小。通过接合实验评估质粒转移能力。使用Illumina和Oxford Nanopore平台进行全基因组测序（WGS）。利用生物信息学方法分析基因组特征。结果 菌株K27是一种泛耐药ST11型肺炎克雷伯菌，能产生3种碳青霉烯酶（NDM-5、KPC-2和VIM-1）。S1-PFGE和全基因组测序均显示，K27菌株携带4个质粒。其中，碳青霉烯酶基因bla_KPC-2位于IncFII（pHN7A8）/IncR杂合质粒（pK27-KPC）上，而碳青霉烯酶基因bla_NDM-5和bla_VIM-1基因由同一IncA质粒（pK27-NDM/VIM）携带。液相接合实验表明pK27-NDM/VIM为接合质粒。结论 这是首次关于临床分离的ST11肺炎克雷伯菌K27携带的碳青霉烯酶基因bla_NDM-5和bla_VIM-1位于同一个质粒上的报道。共携带多种碳青霉烯酶基因和多种类抗菌药物耐药基因使该菌株呈现泛耐药，从而对临床治疗构成严重威胁。

关键词

肺炎克雷伯菌 / 碳青霉烯酶基因 / 质粒 / bla_NDM-5 / bla_VIM-1

基金资助

青大附院“临床医学+X”科研项目(2019-3399)