靶向基因组测序在儿童重症肺炎中的病原学、流行病学及耐药性分析

摘要

目的 探讨儿童重症肺炎的病原谱构成、混合感染特征及耐药基因流行现状，为临床精准诊疗及耐药防控提供参考。方法 采用回顾性队列研究方法，纳入2023年12月至2025年12月山西省儿童医院收治的1 294例重症肺炎住院患儿，采集痰液标本进行靶向基因组测序(tNGS)检测。结果 1 294例患儿中，病原检测阳性率为96.37%。单一感染占11.82%,以肺炎支原体为主；混合感染占84.54%,以病毒+条件致病菌最为常见。病毒检出前5位依次为鼻病毒(22.33%)、人副流感病毒(14.14%)、人腺病毒(12.21%)、EB病毒(11.21%)、合胞病毒(9.04%)。非典型病原中肺炎支原体检出率最高(26.28%)。致病菌中百日咳鲍特菌检出率为10.05%,结核分枝杆菌复合群检出率为0.85%。条件致病菌检出前5位为流感嗜血杆菌(28.05%)、肺炎链球菌(20.56%)、金黄色葡萄球菌(13.83%)、鲍曼不动杆菌(13.21%)、卡他莫拉菌(8.04%)。年龄分层分析显示，巨细胞病毒、百日咳鲍特菌、大肠埃希菌在婴儿组的阳性率显著高于其他年龄组(P<0.001),人副流感病毒3型在幼儿组的阳性率显著高于学龄前及学龄期儿童组(P<0.001)。耐药基因检测显示，肺炎支原体耐药基因(A2063G)检出率为98.23%,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因(mecA)检出率为18.99%,百日咳鲍特菌耐药基因(A2047G)检出率为80.77%。结论 儿童重症肺炎病原谱复杂、混合感染发生率高、病原分布具有年龄特异性，且耐药形势严峻。tNGS技术在早期精准识别病原、明确混合感染类型、预警耐药风险及筛查特殊病原方面具有重要临床价值。

关键词

儿童重症肺炎 / 靶向基因组测序 / 病原 / 混合感染 / 耐药基因

基金资助

山西省自然科学基金资助项目(202203021211242)