生物信息学筛选与分析：非酒精性脂肪性肝病与慢性乙肝肝病进展中的共表达关键基因

摘要

目的 探索非酒精性脂肪性肝病合并乙型肝炎病毒感染状态下共享的分子机制。方法 下载并分析非酒精性脂肪性肝病队列(GSE135251)与慢性乙型肝炎队列(GSE84044)的转录组数据。分别在各队列中筛选差异表达基因，并利用GO、KEGG及GSEA功能富集分析揭示其潜在的生物学功能。基于STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，采用cytoHubba工具识别枢纽基因，随后利用相关数据库预测枢纽基因相关的潜在微小核糖核酸及转录因子，最后采用独立队列(GSE162694、GSE33650)进行受试者工作特征曲线分析，评估枢纽基因的诊断效能。结果 共鉴定出40个在非酒精性脂肪性肝病与慢性乙型肝炎队列中均差异表达的基因。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，筛选出9个枢纽基因：EPCAM、SPP1、COL1A1、SOX9、EFEMP1、THBS2、LUM、LOXL1和FBLN1。预测到几个核糖核酸和几个转录因子作为关键调控元件。结论 本研究以生信的方法识别了9个非酒精性脂肪性肝病合并乙型肝炎病毒感染的枢纽基因及其相关调控因子，这些分子可能成为干预该高风险人群肝纤维化及肝硬化的潜在靶点。

关键词

非酒精性脂肪性肝病 / 慢性乙型肝炎 / 肝纤维化 / 枢纽基因 / PPI互作网络

基金资助

天津市医学重点学科(专科)建设项目(TJYXZDXK-3-026C)