基于XGBoost与地理加权回归的吉林省西部土壤盐渍化反演

李春泽 ,  张超 ,  张皓源 ,  杨翠翠 ,  李珊儿 ,  郧文聚

中国农业大学学报 ›› 2024, Vol. 29 ›› Issue (2) : 1 -10.

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中国农业大学学报 ›› 2024, Vol. 29 ›› Issue (2) : 1 -10. DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2024.02.01
研究论文

基于XGBoost与地理加权回归的吉林省西部土壤盐渍化反演

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Inversion of soil salinization in western Jilin Province based on XGBoost and Geographically Weighted Regression

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摘要

为及时、准确地应用多源遥感数据提取干旱和半干旱区域土壤盐渍化反演特征及获取土壤盐渍化程度的空间分布数据,以吉林省西部大安市为研究区,利用Sentinel-1 SAR、Sentinel-2 MSI多源遥感数据和DEM数据,构建土壤盐分含量(Soil Salt Content,SSC)反演特征集,结合BorutaShap算法优选特征,通过耦合地理加权回归(Geographically weighted regression,GWR)与极限梯度提升树(XGBoost)回归构建土壤盐渍化反演模型,并与XGBoost回归、GWR反演结果对比分析。结果表明:SSC反演特征集中,盐分指数、植被指数在BorutaShap算法中取得了较高的重要性排名,是大安市SSC反演的重要特征。GWR模型的R2和RMSE分别为0.48和4.83 g/kg,XGBoost回归模型的R2和RMSE分别为0.54和4.35 g/kg,耦合GWR与XGBoost回归构建的土壤盐渍化反演模型预测精度得到显著提高,R2与RMSE分别达到0.63和3.71 g/kg。依据该模型反演结果,大安市各类盐渍土分布存在较强的空间异质性,土壤盐分含量呈现出由东南向西北逐渐递减的趋势,与实地调查基本一致。综上,耦合GWR与XGBoost回归模型充分考虑了反演特征的空间异质性和非线性关系,可有效提高SSC反演精度,可获得更符合实际的SSC空间分布,可用于干旱和半干旱地区土壤盐分含量的反演。

Abstract

In order to timely and accurately applying multi-source remote sensing data to extract soil salinization inversion characteristics in arid and semi-arid areas and obtain spatial distribution data of soil salinization degree. Taking Da'an City in western Jilin Province as the research area, Sentinel-1 SAR, Sentinel-2 MSI multi-source remote sensing data and DEM data were used to construct a soil salt content (SSC) inversion feature set. Combined with the BorutaShap algorithm to optimize features, the coupling Geographically Weighted Regression (GWR) with XGBoost regression was used to construct a soil salinization inversion model. The results were compared with XGBoost regression and GWR inversion results. The results show that: The SSC inversion features of this study are concentrated. Salinity index and vegetation index achieve high importance ranking in the BorutaShap algorithm and are important features of SSC inversion in Da’an City. In the soil salinization inversion model constructed, the R2 and RMSE of the GWR model are 0.48 and 4.83 g/kg, respectively, and the R2 and RMSE of the XGBoost regression model are 0.54 and 4.35 g/kg, respectively. The prediction accuracy of the soil salinization inversion model constructed by coupling GWR and XGBoost regression is significantly improved, with R2 and RMSE reaching 0.63 and 3.71 g/kg, respectively. According to the inversion results of this model, there is strong spatial heterogeneity in the distribution of various types of saline soil in Da’an City. The SSC shows a gradually decreasing trend from southeast to northwest, which is basically consistent with the field survey. In summary, the coupled GWR and XGBoost regression model constructed in this study fully considers the spatial heterogeneity and nonlinear relationship of the inversion characteristics, which effectively improves the SSC inversion accuracy. A more realistic SSC spatial distribution can be obtained. This model can be used for the inversion of soil salinity content in arid and semi-arid areas.

Graphical abstract

关键词

土壤盐渍化 / 遥感反演 / 地理加权回归 / XGBoost / 特征优选 / 吉林省西部

Key words

soil salinization / remote sensing inversion / geographically weighted regression / XGBoost / feature optimization / western part of Jilin Province

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李春泽,张超,张皓源,杨翠翠,李珊儿,郧文聚. 基于XGBoost与地理加权回归的吉林省西部土壤盐渍化反演[J]. 中国农业大学学报, 2024, 29(2): 1-10 DOI:10.11841/j.issn.1007-4333.2024.02.01

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土壤盐渍化又称土壤盐碱化,是指由自然因素或人为因素引起的土壤中盐分含量不断累积,并超过一定限度的现象[1-2]。土壤盐渍化引起土壤结构变差,进一步影响作物生长,使产量下降,严重阻碍了区域农业可持续发展[3-4]。全球受初级盐渍化影响的土壤面积约为9.55×108 hm2,而次生盐渍化影响约为7.70×107 hm2,其中58%在灌溉区[5]。我国盐碱地约有9.91×107 hm2,主要分布在我国的东北、西北、华北内陆地区以及长江以北的沿海地带[6]。我国盐碱地分布广、面积大,并且土壤盐渍化呈现不断扩张态势[7]。然而,在我国盐渍化数据贫乏的地区,缺乏准确的土壤盐渍化基础数据。因此,应用多源遥感数据,获取更高精度、高分辨率、更新的土壤盐渍化专题图,对盐碱地的科学开发和利用具有重要意义。
区域盐碱土壤分布特征复杂,包括土壤盐分含量空间异质性以及不同类型盐渍化反演特征之间的非线性关系,给盐渍化土壤的监测带来困难[8]。多光谱影像、SAR影像等多源遥感数据以及地形数据,结合地面调查,可提高区域土壤盐渍化监测的效率和精度[9]。光谱波段、植被指数、盐分指数、地形特征、缨帽变换因子、SAR影像及其衍生的指数等均是土壤盐分含量反演的重要特征,特征选择可以通过减少过拟合来提高模型的预测精度和泛化能力,并简化模型以提高可解释性[10]。杨练兵等[11]针对随机森林回归算法土壤盐渍化反演,将弹性网络、遗传算法、贝叶斯优化算法应用于特征集、模型参数的同步和分步优化。Ge等[12]基于Boruta特征选择算法和多种机器学习算法反演土壤盐渍化,结果表明光谱信息和环境协变量是土壤盐渍化反演的重要特征。遥感特征与土壤盐分之间为非线性关系,机器学习方法擅长处理高维数据和解决非线性问题,成为大范围监测土壤盐渍化的主要方法[13-14]。Zhang等[15]基于双偏振SAR数据,建立了基于一维卷积神经网络的土壤盐分回归模型(DNN-s),实现了土壤盐分含量的反演。Brungard等[16]对比了11种机器学习算法,发现随机森林等更复杂和更精密的建模方法能显著提高土壤属性制图识别的精度。结合辅助变量的地理加权回归可更好地揭示土壤属性空间变异的局部信息,蒙莉娜等[17]通过对比普通克里金、地理加权回归和随机森林3种土壤盐渍化反演模型,发现地理加权回归模型可表现土壤属性指标的局部空间依赖性和异质性。土壤盐渍化程度与环境条件密切相关,模型的预测能力也随着环境条件而变,并且空间距离越近,土壤盐分含量也越相近。选取合适的预测模型,对于准确反演干旱和半干旱地区土壤盐渍化程度尤为重要。GWR结合机器学习方法已应用于人文地理和统计学领域[18-20],GWR算法能充分考虑位置因素对土壤盐分含量的影响,XGBoost算法可准确模拟多因素非线性关系影响下复杂的土壤盐分含量积累过程[21]。目前,结合GWR与XGBoost算法进行土壤盐渍化反演的相关研究鲜有报道,本研究以吉林省西部大安市为研究区,利用多源遥感及衍生数据与土壤表层实测含盐量数据,在BorutaShap算法优化反演特征的基础上,耦合GWR与XGBoost回归进行土壤盐渍化反演,并与XGBoost、GWR算法反演结果对比分析,旨在应用多源遥感数据获取及时准确的干旱和半干旱区域土壤盐渍化程度的空间分布数据,以期为干旱和半干旱区域盐碱地开发利用提供参考。

1 研究区概况与方法

1.1 研究区概况

吉林省大安市地处我国东北地区西部,松嫩平原中南部,位于我国重要的粮食生产基地和世界著名的黄金玉米带。地理坐标为123°08′45″~124°21′56″ E,44°57′00″~45°45′51″ N,总面积约为4 879 km2。该区域地势平坦,东西略高,中间较低,海拔120~160 m,土壤盐分易于积聚于中部低洼地区。大安市地处温带大陆性季风气候区,夏季高温多雨,春季干燥多风。降水量季节变化大,造成了土壤雨季脱盐,旱季积盐的交替变化,加快了土壤中盐分的积累过程。第三次全国国土调查数据显示,大安市盐碱地面积共640.31 km2,占大安市总面积的13.12%,仅次于耕地和草地,主要分布在中部和南部地区。大安市东北部土壤类型主要为黑钙土和淡黑钙土,西南部土壤类型主要为风沙土、盐碱土和草甸土,具有明显的过渡特征,是开展土壤盐渍化遥感反演研究的典型区域。研究区真彩色遥感影像图、样点分布和主要道路见图1。

1.2 土壤样本采集及含盐量分析

综合考虑土地利用类型、土壤盐渍化程度和道路通达性,在研究区布设89个采样点,具体采样点分布见图1。2021年5月16—25日实地采集土壤样品,采用手持式GPS进行采样点定位,基于五点法(距离10 m)进行土壤采样,采样深度为0~20 cm。土壤样品经过自然风干、去除杂质、磨碎、过筛后,测定土壤中Ca2+、K+、Mg2+、Na+、CO32-、HCO3-、Cl-、SO42- 8大离子含量,获得土壤盐分含量(SSC),作为采样点SSC的实际测量值。样点SSC的统计分析见表1,SSC 0.37~30.35 g/kg,均值为8.57 g/kg,整个研究区土壤含盐量较高,标准差为8.37 g/kg,变异系数接近于1,说明研究区土壤盐分含量的空间变异性较强。研究区为典型的苏打碱土区,土壤pH的变化范围在6.99~10.22,整个研究区的pH偏高,变异系数为0.08。

1.3 遥感数据及反演特征构建

采用的遥感影像数据来源于谷歌地球引擎(Google Earth Engine,GEE)。参考土壤盐渍化反演相关研究,选取与样点采集时间相同的Sentinel-1 SAR数据和云量≤10%的Sentinel-2 MSI数据以及30 m分辨率的DEM数据,并计算植被指数、盐分指数、地形指数、缨帽变换因子和主成分变换因子等,构成包含46个特征的特征集,见表2。

1.4 研究方法

首先以贝叶斯优化后的XGBoost模型作为BorutaShap特征选择算法的特征重要性评估器,优化由Sentinel-1 SAR、Sentinel-2 MSI多源遥感数据和DEM数据构建的反演特征集,作为土壤盐分含量反演模型的输入。然后耦合GWR与XGBoost回归构建土壤盐渍化反演模型反演SSC,并与XGBoost回归和GWR方法对比分析,具体流程见图2。

1.4.1 BorutaShap特征选择

通过BorutaShap算法[26]对本研究构建的土壤盐渍化反演特征集进行特征选择,选取反演土壤盐渍化的重要特征,去除冗余特征,减少过度拟合,提高反演精度。BorutaShap是一种包装特征选择方法,该算法主要流程:1)创建特征数据集中所有特征的阴影特征,打乱特征顺序消除变量间的相关性。2)利用贝叶斯优化后的XGBoost模型作为特征重要性评估器,对特征进行排序,以阴影特征的重要性最大值为阈值。3)重要性显著低于阈值的特征被视为“不重要”,并将其从特征集中移除。4)删除所有阴影特征,并重复该过程,直到为每个特征均分配重要性。

1.4.2 土壤盐渍化反演模型

GWR[27]是一种在空间非平稳性和位置相关性假设下对空间关系进行建模的局部回归方法。GWR模型如下:

γi=βi0+∑k=1mβikωki+εi;i=1,…,n

式中:γi 为i位置处的因变量;βi0 为i位置的估计截距; ωki 为i位置 k ={1,…,m}自变量的向量;εi 为i处估计的误差项。在i位置的局部参数估计表示为式(2):

β^i=XTWiX-1XTWiγ 

式中:β^为第k个自变量在i个位置的空间加权估计向量;X为自变量的n×k矩阵;W(i)为n×n对角权重矩阵。如式(3),确保i附近的观测值具有最大的权重值, γ 为因变量的k个观测值向量。

Wij=exp -dijbw

式中:Wij 为估计i而分配给观测j的权重;dij 为j和i之间的距离;bw为带宽。

极限梯度提升树(XGBoost)算法是在梯度提升决策树基础上优化得到的集成学习方法[28],是梯度提升决策树的高效实现。XGBoost模型更新采用梯度提升(Gradient boosting)策略,通过更新损失函数的负梯度方向值来更新模型,其优化方式可以表示为:

O∅=∑ilyi^,yi+∑nΩfn

其中

Ωfn=γT+12λω2

式中:l(yi^,yi)为损失函数,即均方根误差;Ω(fn)为正则化项;γ为模型复杂度;T为模型中叶子结点个数;λ为固定系数; ω 为叶子节点量化权重向量。

耦合GWR与XGBoost回归构建土壤盐渍化反演模型,具体过程如下:1)对于每个样本点i,用除i之外的数据训练XGBoost模型;2)使用训练好的模型,计算样本点i数据的预测值;3)使用真实值和预测值计算残差,捕获变量间的非线性关系;4)将数据和残差传递给GWR模型,捕获每个数据的空间相关性。5)将GWR模型残差与真实值传递给对所有样本点训练的全局XGBoost模型,计算全局XGBoost模型预测结果。土壤盐渍化反演模型见图3。

1.4.3 模型精度验证

随机选取30%的样本作为验证样本,训练数据集和验证数据集相互独立,采用决定系数(R2)和均方根误差(RMSE)评估模型精度。

R2=1-∑i=1nVpi-Voi2∑i=1nVoi¯-Voi2
RMSE=1n∑i=1nVoi-Vpi2

式中:Voi 为样本点i处的实测值;Vpi 为点i处的预测值;n为总样本点个数。R2在0~1,越接近1,模型的稳定性越高;RMSE越小,则模型预测土壤盐分含量的精度越高。

1.4.4 土壤盐渍化程度分级标准

参照文献[29-30]拟定的土壤盐渍化程度分级,本研究根据SSC将大安市土壤盐渍化程度分为盐渍土(SSC>10 g/kg)、重度盐渍化(6~10 g/kg)、中度盐渍化(3~6 g/kg)、轻度盐渍化(1~3 g/kg)、非盐渍化(<1 g/kg)5级,并依据此标准对大安市土壤盐渍化反演结果绘制SSC专题图。

2 结果与分析

2.1 基于BorutaShap的反演特征优选

以贝叶斯优化算法优化后的XGBoost模型作为BorutaShap算法的特征重要性评估器,XGBoost模型优化参数、优化空间和优化结果见表3。

由图4可知,对于大安市土壤盐渍化反演特征集,Sentinel-2 MSI原始波段反射率中,B2波段为盐渍化反演重要波段。植被指数中重要的反演特征为CRSI、TBI、SAVI、ENDVI、DVI,其中CRSI与TBI具有较高的重要性排序。盐分指数中,NDSI是SSC反演的重要特征。缨帽变换因子、主成分分析波段等二次特征中,PCA2对SSC反演比较重要。本研究重要的地形特征为TWI、Elevation、CNBL、TCA和VD。但本研究区域地势较为平坦,地形因素在本研究区土壤盐分反演中未起决定性作用,因此地形特征的重要性排序较低。本研究构建的SAR数据及衍生指数,VV、VH、Ratio、NDI被选为SSC反演的重要特征。本研究中LULC取得了较高的重要性排序。

2.2 SSC反演精度对比分析

由图5可知,耦合GWR与XGBoost回归方法预测值与测量值更为接近,精度最高,R2和RMSE分别为0.63和3.71 g/kg。XGBoost回归模型的 R2和RMSE分别为0.54和4.35 g/kg,而在GWR模型中R2和RMSE最差,分别为0.48和4.83 g/kg。

由图6可知,大安市SSC呈现出由东南向西北逐渐递减的趋势。大安市东南侧及中部地势较为低洼,盐分易于累积,因此南部和中部反演结果主要为盐渍土、重度盐渍化土和中度盐渍化土。大安市西北部主要土地类型为林地与耕地,该区域反演结果多为轻度盐渍化土壤和无盐渍化土壤。根据耦合GWR与XGBoost回归方法制作大安市SSC专题图,大安市各类盐渍土分布存在较强的空间异质性。大安市轻度和中度盐渍化土壤面积占比最大,西北部和北部SSC相对较低,SSC高的区域主要集中在植被覆盖较少的东南部和南部地区。

通过对比GWR、XGBoost和耦合GWR与XGBoost回归3种土壤盐渍化反演方法,GWR方法反演结果平均SSC较高,XGBoost方法反演的SSC空间连续性较差。耦合GWR和XGBoost回归方法预测精度最高,并且该方法对SSC的空间局部变异信息描述更精细,较好地反映了研究区SSC的空间异质性及其变化规律。因此,结合机器学习算法与地理加权回归可以显著提高土壤盐渍化反演精度。

3 讨论

通过实地调查获得大范围的土壤盐渍化信息通常是费力且困难的,因此大部分土壤盐渍化反演研究中土壤采样数据稀疏。针对这一问题,Wang等[13]引入图像处理领域的Mixup数据增强方法增加样本多样性。Ge等[12]通过Bootstrap方法对样本进行重采样,有效地解决了构建模型时出现的小样本问题。本研究中土壤样本点同样稀疏,下一步应重点考虑采用数据增强的方法,增强土壤盐分含量样本点数据,提高小样本条件下的土壤盐渍化反演精度。

土壤盐分聚集在地势低洼的地区,本研究中地形因素对于吉林省西部大安市的土壤盐分含量累积并未起决定性作用,但在Peng等[22]和蒙莉娜等[17]的研究中,地形因素均取得了较高的重要性排序,这证明不同区域决定土壤盐分含量的主导因素不同。在自然环境中,由于土壤湿度、植被覆盖和数据采集时间等其他因素的干扰,利用遥感技术很难获得盐渍土的纯光谱信息[10],SSC可以通过作物长势间接表达,因此植被指数是土壤盐渍化反演的重要特征,本研究土壤盐渍化反演取得了较高的重要性排序。土地利用类型是人类活动影响SSC的重要表现,土地利用方式与农田灌溉方式是影响土壤盐渍化程度的重要因素[12],本研究中LULC是重要特征之一。目前GWR结合机器学习方法主要应用在人文地理和统计学领域,在土壤盐渍化反演方面的应用还十分有限,构建土壤盐渍化反演的空间变系数的机器学习模型需不断地进行研究,以便构建适宜不同区域的土壤盐渍化反演模型。

4 结论

本研究基于实地采样点的土壤盐分含量,结合光学、SAR遥感数据和地形数据,构建了46个反演特征,耦合GWR和XGBoost回归方法对吉林省西部大安市表层土壤盐分含量的空间分布进行反演。盐分指数、植被指数在大安市土壤盐分含量的反演中发挥重要作用,反演特征对土壤盐分含量的表征能力存在区域异质性。耦合GWR与XGBoost回归模型充分考虑了反演特征的空间异质性和非线性关系,可有效提高土壤盐分含量反演精度,且该模型对土壤盐分含量的空间局部变异信息描述更精细,可用于干旱和半干旱地区土壤盐分含量的反演。

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