种子是农业的“芯片”,种业是国家战略性、基础性的核心产业
[1]。南繁基地作为新品种选育的“加速器”,我国新育成农作物品种中超70%经过南繁选育,但种业科研周期长、投入大、专业化程度高
[2]。传统的南繁工作,主要是育种家或遗传学家仅以科研材料的冬季加代繁育,南繁季后再把大量的育种或遗传材料运送回北方,经常发生珍贵材料运输途中损失事故。据统计,传统的育种工作中种质资源流转周期平均3~6个月,南北调运育种材料中任务对接耗时超40%,环境数据采集误差率>15%。更为艰巨的挑战是,随着生物育种产业化加快推进,大部分科研主体难以独立完成全部科研环节,单一领域科研难以形成较大突破,亟需分工协作集成创新。CRO(Contract research organization,合同研究组织)起源于医药行业,是指通过合同形式为制药企业、生物技术公司或医疗器械企业提供药物研发全流程专业化外包服务的科学机构。在作物育种行业,国际上也有通过CRO分工协作的服务,如先正达(Syngenta)、科迪华(Corteva)为中小型农场或区域公司按照客户的目标性状需求,提供从基因挖掘到田间测试的全流程定制化育种服务,包括杂交组合测试、性状导入等,按合同收取研发费用。1989年在荷兰瓦赫宁根创立的农业生物技术公司KeyGene,依托其核心专利技术,开发了基因解析、特征发现、数字表型、精准育种、细胞和组织设计以及基因组育种六大作物创新技术平台,通过CRO方式实现商业化,核心技术IP授权的方式支持合作伙伴在植物育种和研究方面的个性化需求。面对当前育种科研逐步趋向多资源集中、多学科交叉和多因素需求的特点,当前育种科研服务存在以下3个客观困难:一是国家层面大型科研平台设施建设标准与科研需求不匹配(使用率<65%),难以实现高效共享利用;二是服务响应时效与育种周期不匹配(平均响应延迟72 h),科研服务对接和交付时间长;三是数据采集精度与试验要求不匹配,开展分子育种的基础科研耗材和表型观测设备不足。
现代种业已进入以“常规育种-现代生物技术育种-信息化育种”为特征的育种4.0时代
[1]。近年来,随着国家种业振兴战略的实施,海南省依托自由贸易港加快南繁硅谷建设,南繁科研服务信息化能力亟待补足
[3]。因此,本研究拟基于大数据和物联网技术,设计开发种业南繁CRO服务管理平台,通过整合科研服务资源条件、提升作物育种全链条数字化水平,以期提高南繁科研和育种创新效率,促进科研单位、种子公司和农民合作社等产业链各方的协作,发展服务南繁种业的新质生产力。
1 种业南繁CRO服务平台设计方案
在海南省率先开展面向南繁育种科研创新的CRO服务,建立种业南繁CRO服务管理平台,实现一站式、全流程服务,要满足技术整合和标准化需求、数据共享和知识产权安全需求以及客户简单易用需求。平台的设计方面要集成大数据、云计算、物联网和人工智能等技术,同时要对接提供服务的工作人员
[4],确保平台的操作可以被快速接受和有效使用。本研究参照医药研发CRO服务模式相关系统,高水平打造种业南繁CRO服务管理平台和科研基地物联网技术应用,让南繁育种科研工作智能化、精细化和高效化,让服务平台充分发挥育种效率提升的“加速器”优势
[5]。
1.1 设计需求
1)对接全链条用户。平台开发除满足运营管理人员的常规需求外,服务提供方和使用方也较为多样
[6]。一是育种科研单位和企业,属于主要的服务使用方,需满足各环节服务咨询、订单下达、数据获取、线下对接等功能
[7];二是CRO服务单位,属于主要的服务提供方,需满足服务上线、服务对接、服务交付、信息管理等功能;三是运营管理方,需满足服务商管理、服务信息和公共信息发布、线下服务点管理和客服咨询等功能。
2)实现多场景集成。平台要实现科研育种业务“一站式”服务,不局限于某一类农作物或某一类农业服务,而是包括实验室育种服务、检验检测服务、田间育种服务和知识产权服务等其他服务。同时,根据地方发展环境,可以提供育种科研场地租赁、大型公共仪器使用、个性化服务配置等。
3)兼容模块化技术。技术服务的提供方在全链条服务中往往只能提供一个环节的技术服务,而平台构建可以根据需要灵活扩展功能模块以及接入新的技术手段
[8]。同时,通过数据整合保证各板块数据互通与标准化,实现数据流通与共享,促进农业大数据的整合应用
[9]。
4)信息安全高标准。通过线上平台,建立严格的数据访问权限管理,确保只有授权用户能访问敏感数据。采用传输加密(SSL/TLS)、存储加密(SM4)及完善的密钥管理,利用Sm3Hmac数字签名技术实现数据的不可篡改性,引入多因素身份验证(MFA)
[10],并通过数据隔离与分区管理确保不同育种单位数据的独立性。从管理、技术和操作流程多方面入手,通过分类标识、专属存储和隔离区设置保护育种材料,同时部署监控和安保措施防止人为破坏
[11-12]。数据安全需通过物联网设备实时采集、云端同步、加密传输和多地点备份
[8],避免因设备故障或突发事件导致数据丢失
[13]。标准化操作流程和权限管理则确保材料和数据的规范化使用,并通过人员培训提高安全意识。
1.2 系统架构
为整合南繁科研育种领域上游、中游和下游种业CRO服务资源,设计的种业南繁CRO服务管理平台整体系统架构如
图1所示。系统架构分为基础设施层、能力支撑层、业务应用层、展示层和用户层,实现服务资源整合,依托崖州湾先进计算机中心信息设备和通信网络基础设施,为科研单位、高校和种业企业提供全流程种业CRO服务。
1)基础设施层。依托崖州湾先进计算机中心(云主机、存储设备、安全设备、网络设备),田间物联网设备(气象、土壤、水质、表型机器人/监控、虫情灯、孢子仪)和通信网络(互联网、5G/4G设备)等基础设施,为应用平台提供基础设施支撑、运行环境和安全保障。
2)能力支撑层。通过崖州湾已建成统一身份认证平台,使用多源异构数据集成平台接入科研基地田间物联网设备、视频流和业务数据,集成消息、日志、电子签章、物联网和视频等服务,为应用平台提供基础能力支持。
3)业务应用层。应用平台搭建综合服务管理子系统、CRO服务管理子系统、南繁数据管理子系统和系统管理子系统4个业务板块,支撑从服务商家入驻、CRO服务商品发布、运营管理、科研主体用户下单选购、试验基地数据采集,到数据分析和科研成果转化一整套种业科研全流程服务。
4)展示层。基于4个业务应用子系统,提供PC端平台统一门户、移动端南繁CRO小程序和大屏端智慧南繁指挥大屏3个展示与应用终端。
5)用户层。应用平台面向涉及科研育种全流程所有用户,包括政府部门、科研单位/高校、CRO服务单位、种业企业、农户和社会公众等用户。
1.3 技术选型
应用平台使用B/S架构,前后端分离模式。后端接口使用Java开发,基于SpringBoot框架搭建,通过Jwt-Token机制进行身份鉴别和权限控制。数据库使用国产达梦数据库DM8和Redis缓存数据库。前端UI界面基于Node.js开发,使用Vue3和uni-app框架搭建。集成开发工具选用IntelliJ IDEA、Eclipse和VSCode,源代码版本控制使用Git,软件测试工具使用Jemeter。应用运行中间件选用Tomcat,WEB中间件选用Nginx作静态资源转发和反向代理。系统部署服务器选用4台国产统信操作系统UOS20云服务器(8核16G内存400G存储),分别为WEB服务器、应用服务器、数据库服务器和备份服务器,并配备独立公网IP(20M以上带宽)和域名。
1.4 业务流程
1.4.1 科研育种辅助决策流程
作物科研育种包括基础研究及育种技术开发、品种选育、中间试验、品种审定、种子生产加工和品种推广等阶段。在育种全流程中,涉及实验室育种服务、检验检测服务、田间育种服务、知识产权服务和其他CRO服务,科研育种辅助决策流程见
图2。通过科研基地物联网信息化建设,采集基地水、土、气环境数据,监控数据,病虫害数据和作物表型数据,形成科研育种大数据;通过人工智能算法模型,为科研人员筛选作物性状、新品种选育提供辅助决策工具。
1.4.2 CRO服务业务流程
1)商品发布。CRO服务商家通过平台进行入驻申请,运营单位对商家进行审核,商家入驻审核通过后成为CRO服务商。商家可以上传CRO服务商品,平台对商家上传的商品信息进行合规性审查,审查通过后,商家可以将它们上架发布。
2)用户下单。科研单位、高校和种业企业等用户通过统一身份认证平台注册、登录后,可以通过PC端或移动端小程序浏览已经发布上架的CRO服务商品,下单购买,采购服务商品。商家接到用户下单信息后,进行接单,提供CRO服务。服务完成后,用户可以进行服务结果确认,服务评价。
2 种业南繁CRO服务管理平台实现
2.1 软件设计及开发
系统使用B/S架构,前后端分离模式。数据库使用达梦数据库,缓存使用redis缓存数据库。后端接口使用Java语言开发,基于SpringBoot框架搭建,使用Token(JWT)机制实现数据和接口权限控制。前端页面开发基于Node.js环境,使用Vue3和uni-app框架搭建。系统开发流程共分为3个步骤:第一步,数据库设计。根据CRO业务流程和物联网设备传感器类型,设计系统权限、CRO业务和物联网数据相关库表。第二步,开发系统权限控制、CRO业务管理和物联网数据管理接口。根据业务需求开发数据管理接口,提供物联网数据接入存储、CRO业务数据查询、编辑和删除等功能。同时,安装部署监控摄像头、气象站、水质传感器、土壤传感器、虫情灯、孢子仪和表型机器人等物联网设备,通过物联网数据接口接收设备数据,解析后存入数据库。第三步,开发PC端和移动端前端界面,包括系统管理子系统、CRO服务管理子系统、综合服务管理子系统和南繁数据管理子系统。
2.2 系统实现
平台建设采用“1+3+4”模式,即1个种业南繁CRO服务管理平台,PC端统一门户、移动端南繁CRO小程序和大屏端智慧南繁指挥大屏3个应用终端,综合服务管理子系统、CRO服务管理子系统、南繁数据管理子系统和系统管理子系统4个业务系统,主要实现以下3个方面功能:
1)商家入驻和CRO服务商品发布。平台支持商家入驻,已经入驻的CRO服务商家可以新增商品信息。运营人员可以对商家和商品进行推荐、发布广告和活动等。
2)用户下单采购服务。科研单位、高校和种业企业用户可以浏览CRO服务商品,下单购买服务。
3)服务数据分析与供需调度。统计分析商家入驻数据、商品发布数据、服务交易数据和南繁服务站数据等,构建智慧南繁CRO数字看板,让运营管理人员一屏全览南繁CRO服务全貌,为智慧决策和供需调节提供数据支撑。
2.3 科研基地物联网技术集成应用
以崖州区4个智慧南繁实验基地为研究对象,基地分别位于坡田洋、高地村、坝头村和红旗队,占地96.53 hm2,主要进行水稻、玉米作物科研育种。为实时监测科研基地田间小气候、土壤环境、水环境、病虫害情况和作物生长情况,部署气象站33套,土壤监测站20套,水质监测站2套,智能虫情测报灯9套,智能病菌孢子仪3套,作物生长监测高清球形摄像机54套,作物表型机器人1套。科研基地物联网技术应用可分为田间环境监测和试验辅助决策2个部分:
1)田间环境监测。在田间安装高清球机、气象监测站、土壤监测站、水质监测站、智能虫情灯、病菌孢子仪和作物表型机器人等环境和作物表型监测设备,实时对田间作物生长情况、小气象、土壤、水环境、虫害、病害变化和作物表型等进行监测,采集田间环境和作物生长数据。
2)田间试验辅助决策。根据监测设备采集的作物生长数据、空气温度、空气湿度、光照强度、风向、风速、降雨量、大气压、二氧化碳浓度、土壤温度、土壤湿度、水质PH、水溶解氧、虫害数据和病菌孢子等信息,通过大数据分析技术,辅助科研人员进行科研试验分析、作物性状筛选,加速科研育种进程。
3 种业南繁CRO服务平台的实施效果分析
3.1 科研育种效率
种业南繁CRO服务管理平台与传统南繁在科研育种各环节相比效率均有较大提升,主要指标对比情况见
表1。一是资源引进环节,借助海南自贸港政策,合规速度从90 d缩至30 d;二是资源利用上,数据共享使资源库调用从1~2周实现秒级检索;三是科研育种方面,表型采集、育种效率等大幅提升;四是测试评价、检验检测环节,时间显著缩短;五是成果保护与转化上,新品种权保护申请时长缩短,育种成果转化率从10%<提升至20%~30%。总体来看,CRO服务平台在各环节均展现出明显的效率优势。
3.2 试验基地环境精准监测
通过物联网技术,实现了对南繁基地的实时监测,科研人员可以通过手机或电脑随时查看田间数据,通过物联网设备,实时监测土壤湿度、温度、养分以及气候数据(如光照、降雨量、温度),为科研人员提供精准数据支持,帮助科研人员更精准地掌握田间操作时间节点,提高育种效率。部署气象、土壤、水质、孢子仪、虫情灯和作物表型机器人等设备122台(套),可实现:1)环境参数采集精度达0.01级;2)异常状态预警响应时间10 min;3)数据采集频率从人工1~2次/d提升至自动240次/d。此外,物联网系统每6 min更新一次数据,确保科研人员能够及时调整田间管理措施。
综上,种业南繁CRO服务管理平台通过整合资源、优化服务流程、引入物联网技术等措施,显著提升了南繁科研工作的智能化、精细化和高效化水平。各类科研主体的多样化需求得到了满足,各板块使用量不断增加,线上采购时间大幅缩短,物联网接入保证了实时监测,为南繁科研提供了强大的技术支持。
4 结论与展望
4.1 结论
通过搭建种业南繁CRO服务管理平台,实现了与物联网技术协同,建立了覆盖南繁种业科研全链条,从种质资源选择、育种试验设计、试验田管理、数据采集与分析到成果转化的科研育种全生命周期的种业南繁CRO服务管理体系,结合精准环境监测、作物表型监测、人工智能、大数据分析、多层级权限管理、数据加密和区块链溯源等技术手段,实现育种效率提升30%,成果转化效率提升15%。研究证实南繁CRO服务有效拓展了南繁功能边界,推动科研育种向数字化、集约化转型。
种业南繁CRO服务管理平台系统已成为农业信息化技术在种业领域的典范案例,平台使用了uni-app、Vue3、SpringBoot、GIS等最新软件架构和技术,集成了种业上游、中游和下游CRO服务,实现了从种质资源筛选到育种成果转化的全链条数字化管理,有效提升了科研效率。通过精准的数据采集和智能化管理,平台优化了实验田布局和育种流程,减少了试验周期,降低了成本。同时,基于人工智能和大数据分析,平台提供动态预测和育种模型优化,帮助科研人员更快、更精准地选择优质品种。通过高安全级别的数据和材料保护,科研单位能够放心共享数据资源,促进合作与创新,加速科研成果转化,为粮食安全和种业竞争力提供科技保障。
4.2 展望
种业南繁CRO服务管理平台于2024年10月发布上线,截至2025年1月已入驻80余家CRO服务主体,包括三亚崖州湾科技城已集聚的50余家各类种业CRO服务主体(其中20家被认定为海南省南繁种业CRO组织),共发布了400多个CRO服务商品(包括实验室育种服务、检验检测服务、田间育种服务、知识产权服务和其他服务)。其中南繁共享用地服务板块已上传3 200 hm2南繁基地信息(已用和待用土地信息),完成了240 hm2土地流转交易,为科研机构和企业提供“一站式”线上看地、选地、租地服务。当前系统在边缘计算能力(时延>200 ms)、多源数据融合(异构数据整合度82%)等方面仍需优化。种业南繁CRO服务管理平台还处于服务和育种数据快速积累和应用阶段,随着平台的不断推广,后台大量数据汇聚,南繁CRO服务+物联网技术协同应用成效将进一步释放。下一步,平台的功能将进一步拓展,研究开发基于数字孪生的虚拟育种系统,充分利用人工智能技术,推动南繁育种向更加智能化、规模化发展,助力国家南繁种业振兴。
三亚崖州湾科技城科研项目(2022菁英人才项目)