牛SLC38A基因家族的生物信息学分析及其在前体脂肪细胞分化中表达模式分析

焦若普, 张久盘, 宋雅萍, 姜超, 宋小雨, 杨东梅, 龚红芳, 马艺伦, 黄永震, 房义, 马云, 魏大为

中国农业大学学报 ›› 2025, Vol. 30 ›› Issue (11) : 160 -170.

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牛SLC38A基因家族的生物信息学分析及其在前体脂肪细胞分化中表达模式分析

    焦若普, 张久盘, 宋雅萍, 姜超, 宋小雨, 杨东梅, 龚红芳, 马艺伦, 黄永震, 房义, 马云, 魏大为
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摘要

为系统解析溶质载体家族38(Solute carrier family 38)在牛中的进化水平、分子结构及功能特性,本研究利用生物信息学技术分析了SLC38A基因家族基因特征,并结合RT-qPCR技术检测其在脂肪组织及时序分化的脂肪细胞中的动态表达模式。结果表明:1)SLC38A基因家族成员在等电点和分子量上存在显著差异。2)染色体定位揭示了SLC38A基因家族在牛基因组中的具体位置;系统进化树与保守结构域分析表明,SLC38A基因家族成员在进化过程中形成了不同的基序和结构域组合;共线性分析表明了SLC38A基因家族成员在牛与不同物种之间的位置变化规律。3)RT-qPCR结果显示SLC38A1/A2/A10在牛脂肪组织中表达量较高,且安格斯牛中的表达量显著高于西门塔尔牛;在脂肪细胞分化过程中,其表达量于第2天短暂下调后,在分化后期显著上调。综上,本研究探究了SLC38A基因家族在牛与其近缘物种及其他物种间的进化水平、分子结构及功能特性,揭示了SLC38A基因在脂肪代谢和能量平衡中的关键调控作用,为深入解析该基因家族在脂质代谢调控中的分子机制研究提供了一定理论基础。

关键词

SLC38A基因家族 / 生物信息学分析 / 表达模式

Key words

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牛SLC38A基因家族的生物信息学分析及其在前体脂肪细胞分化中表达模式分析[J]. 中国农业大学学报, 2025, 30(11): 160-170 DOI:

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