番茄CBF基因家族全基因组分析

摘要

为鉴定番茄CBF基因家族、初步探究SlCBFs基因的生物学功能，基于拟南芥、水稻和马铃薯CBF基因，在番茄（Solanum lycopersicum L.）中筛选出6个CBF基因，并对其理化特征和组织表达模式等进行了系统的比较分析，明确了CBF基因家族在番茄响应低温胁迫的功能。结果表明：1）系统进化树分析显示植物CBF基因家族分为4个亚组，其中番茄SlCBFs家族成员分布在GroupⅠ和GroupⅡ2个亚组中，与水稻CBF基因家族所在的GroupⅣ存在明显区别；2）顺式作用元件分析发现了1 072个可能调控CBF基因表达的顺式元件，其中生长发育响应元件最多，占72%;3）组织转录表达分析结果表明，SlCBF1、SlCBF2、SlCBF3和SlCBF4基因在果实破色期表达量较高，推断SlCBFs基因家族在植物果实发育过程中可能起到重要作用；4）低温胁迫处理发现SlCBF1、SlCBF2、SlCBF3、SlCBF4和SlCBF5基因表达水平明显上调。综上，深入探究番茄CBF基因家族的生物学功能，可为番茄新品种创制提供理论基础。

关键词

番茄 / CBF基因家族 / 生物信息学 / 基因表达分析 / 进化关系