新疆鸡源产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌流行特征与耐药基因分析

摘要

为了解新疆地区蛋鸡养殖场中产超广谱β-内酰胺酶（Extended-spectrum β-lactamases,ESBL）肺炎克雷伯菌的流行特征及耐药基因携带情况，本研究从新疆5个地区6个蛋鸡养殖场采集鸡粪便样本进行肺炎克雷伯菌的分离鉴定，并采用CLSI推荐的ESBL鉴定产ESBL菌株，通过微量肉汤稀释法对其进行药敏试验；选取不同地区的产ESBL菌株进行全基因组测序，分析菌株所携带的耐药基因及质粒复制子类型，并基于核心基因组构建系统发育树。结果显示：1)1 115份鸡粪便样品中共鉴定出产ESBL肺炎克雷伯菌39株，检出率为3.5%。2)所有产ESBL分离株对四环素、头孢噻肟和环丙沙星的耐药率分别为89.7%、87.2%和84.6%，对美罗培南均敏感。多重耐药菌株占比97.4%。3)35株不同地区产ESBL菌株中共检测到12类66种耐药基因，bla_SHV、oqxA和oqxB的携带率最高（均为97.1%）。共发现14株携带介导替加环素耐药的外排泵基因tmexCD-TOprJ，主要分布在ST37（11/14）中。4)共检测到12种质粒复制子，82.9%（29/35）的菌株携带至少1种复制子类型，其中IncFIB（K）最为常见（72.4%）。5)35株菌共鉴定出12种ST型，整体呈现较高的遗传多样性。未发现跨区域的克隆传播，但在塔城鸡场中检测到ST37、ST307、ST5116与ST200等ST型的紧密聚类。综上，新疆蛋鸡养殖场中产ESBL肺炎克雷伯菌检出率较低，但菌株耐药谱广、携带多种耐药基因与质粒复制子，且部分菌株存在克隆传播风险，提示需加强区域性耐药菌监测、合理使用抗菌药物以降低耐药菌传播。

关键词

超广谱β-内酰胺酶 / 肺炎克雷伯菌 / 耐药基因 / 质粒