牛PPP1R3基因家族的生物信息学分析及PPP1R3C基因的mRNA表达水平分析

吴昊; 张久盘; 宋雅萍; 姜超; 宋小雨; 焦若普; 杨东梅; 马云; 魏大为

中国农业大学学报 ›› 2025, Vol. 30 ›› Issue (3) : 13 -23.

吴昊, 张久盘, 宋雅萍, 姜超, 宋小雨, 焦若普, 杨东梅, 马云, 魏大为

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摘要

为系统分析PPP1R3C所在基因家族于牛及其他物种间的进化水平、分子结构及功能特性，本研究利用生物信息学技术分析了PPP1R3C所属家族—PPP1R3基因家族基因特征，并采用RT-qPCR检测PPP1R3C基因的表达水平。结果表明：1)PPP1R3基因家族成员在等电点和分子量上存在显著差异。2）进化树和保守结构域分析表明，PPP1R3基因家族成员在进化过程中形成了不同的基序和结构域组合；共线性分析表明了PPP1R3基因家族成员在牛与小鼠、人类、绵羊及家猪染色体之间的位置变化规律。3)RT-qPCR检测结果显示，PPP1R3C基因在牛的脂肪和肺组织中具有显著的高表达，而在肌肉相关组织中的表达水平最低；随着牛脂肪细胞分化成熟，其表达水平逐步提升。综上，本研究探究了PPP1R3基因家族在牛及其他物种间的进化水平、分子结构及功能特性，揭示了PPP1R3C基因在脂肪代谢和能量平衡中的关键调控作用，为深入研究该基因家族在不同生理和病理状态下的具体机制提供了一定的理论基础。