蒙古冰草XTH基因生物信息学及干旱胁迫下表达分析

陈艺豪; 房永雨; 范菠菠; 张学峰; 赵彦; 闫秀秀; 吴婧; 翟永青; 于卓; 马艳红

中国农业大学学报 ›› 2025, Vol. 30 ›› Issue (1) : 55 -64.

陈艺豪, 房永雨, 范菠菠, 张学峰, 赵彦, 闫秀秀, 吴婧, 翟永青, 于卓, 马艳红

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摘要

为筛选出蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng）抗旱相关的XTH基因，利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及二、三级结构进行分析，并对4个抗旱相关的XTH基因进行表达分析。结果表明：筛选得到的7个蒙古冰草XTH基因，蛋白大小位于70～357 aa，分子质量为7.67～39.46 ku，理论等电点（PI）在4.67～9.81，均为亲水性蛋白；亚细胞定位表明AmXTH-1定位在细胞壁和细胞质，其余6个定位于细胞壁。XTH基因的二、三级结构以无规则卷曲为主，推测motif1、motif2和motif3为保守基序。进化关系比对发现AmXTH30、AmXTH28-1、AmXTH-1和AmXTH8-1与已知具有抗旱功能的基因具有较高相似性。qRT-PCR分析表明，4个与蒙古冰草抗旱相关的XTH基因均呈下调表达。推测蒙古冰草中差异表达的4个XTH基因在响应干旱胁迫中起负调控作用。