彩色马铃薯ARF基因家族的鉴定与表达分析

摘要

为鉴定参与彩色马铃薯花青素合成相关的ARF基因，基于马铃薯转录组测序数据，利用生物信息学方法对其基因家族成员进行理化性质、系统进化、保守基序、启动子顺式作用元件等进行分析，并通过qRT-PCR验证9个与花青素合成相关的StARFs基因在不同生长时期的紫肉和白肉马铃薯中的表达模式。结果表明：筛选得到55个StARFs基因，可分为4个亚族；同一亚族成员呈现出相似的保守基序和保守结构域，表明其具有相似的功能。启动子顺式元件预测结果显示，其中9个StARFs均含有激素响应作用元件，5个StARFs含有MYB结合位点响应元件。此外，7个StARFs在黄皮白肉马铃薯‘大西洋’中高表达，在‘华颂66’中低表达；2个StARFs在紫皮紫肉马铃薯‘华颂66’中高表达，在‘大西洋’中低表达。这9个StARFs基因极有可能参与马铃薯块茎花青素的生物合成过程。

关键词

彩色马铃薯 / 花青素 / ARF转录因子 / 生物信息学 / 表达模式