非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫刺激雏鸡胸腺细胞的转录组学分析

摘要

为研究非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫（Nonreplicating Toxoplasma uracil auxotrophs,NRTUAs）在转录组水平对雏鸡胸腺的免疫调节作用，本研究以接种NRTUAs虫株3 d的雏鸡为试验对象，利用RNA-seq技术对其胸腺组织进行转录组测序以挖掘其中的差异表达基因（DEGs），进而对得到的DEGs进行GO功能注释、KEGG信号通路富集分析和蛋白互作网络分析。结果表明：1）筛选出964个DEGs，其中517个基因表达上调，447个表达下调。2）通过GO功能注释发现差异基因在生物过程、细胞组分和分子功能三大类别显著富集在免疫应答、防御反应、对外界刺激反应、对刺激反应、细胞外区域、细胞表面等条目。3)KEGG信号通路富集分析发现DEGs显著集中在细胞因子及其受体相互作用、IgA产生的肠道免疫网络、细胞粘附分子、Toll样受体信号通路等通路上。4）通过蛋白互作网络分析发现9个重要的关键分子，其中IL-6和IL-18具有调节细胞分化促进干扰素产生的功能，IRF1和IRF7能够调节巨噬细胞等细胞的活化以及抗原递呈能力，SOCS1能够防止STAT1信号通路异常活跃而导致的过度炎症反应，CCL4、CCR5和CCL20作为趋化因子能够诱导多种免疫细胞浸润炎症区域，CD40能够增强抗原递呈进而调节机体的免疫功能。综上，NRTUAs虫株刺激雏鸡胸腺后，胸腺细胞的增殖活动减弱，T细胞活化以及细胞因子分泌等活动增强，并且IL-6、IL-18、IRF1、IRF7、SOCS1、CCL4、CCR5、CCL20和CD40是NRTUAs虫株调节雏鸡胸腺细胞的重要分子，本研究为深入探讨NRTUAs虫株调节家禽胸腺的先天性免疫反应的分子机制提供了理论依据。

关键词

非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫 / 转录组学 / 雏鸡 / 胸腺