吉林省大豆品种（系）遗传多样性分析

摘要

为明确吉林省2003—2022年育成的大豆品种（系）的遗传距离和亲缘关系，选取2003—2022年育成的299份大豆品种（系）为试验材料，利用覆盖大豆基因组的SNP标记对其进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明：1)3 240个SNP标记在参试材料中共检测出A/A、A/G、A/T等16种基因型，分子标记多态信息量（PIC）范围为0.009 9～0.556 1，平均值0.318 4；使用Powermarker vision 3.25软件，得到样本群体等位基因频率为0.688 3、平均PIC为0.318 5。2）参试材料间遗传相似系数在44.86%～95.46%，平均为63.40%；其中，遗传相似系数在60%～70%的材料最多，样本数为170份，占参试材料的56.86%。3）根据遗传距离将参试材料划分为4个类群，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ类群分别含有8、3、115、173份品种（系）；来源于同一育种单位的品种（系）一般划分到同一类群。4）进一步利用STRUCTURE进行遗传结构预测，结果显示K=4，表明参试的299份品种（系）可被划分成4组独立的遗传结构类群；第1、2、3、4遗传结构类群分别含有24、18、105、152份品种（系），第1遗传结构类群含祖先遗传物质最多，第2、3、4遗传结构类群中外引遗传物质占比逐渐增多，第4遗传结构类群中外引遗传物质占比为46.80%。综上，参试大豆品种群体总的遗传背景相对狭窄，但随着外引遗传物质的引入，第4遗传结构类群（152份）的遗传多样性显著高于总体水平。

关键词

大豆 / 品种 / SNP分子标记 / 遗传多样性 / 聚类分析

基金资助

国家重点研发计划（2021YFD1201603）; 吉林省农业科学院基本科研经费项目（KYJF2023DX002）