鸡肌肉发育相关miR-133c-3p靶基因筛选与鉴定

朱师良; 陈家磊; 彭涵; 熊霞; 胡陈明; 杨礼; 宋小燕; 夏波; 余春林; 邱莫寒; 张增荣; 杜龙环; 汪江先; 熊柱翔; 杨朝武

中国农业大学学报 ›› 2025, Vol. 30 ›› Issue (8) : 120 -131.

朱师良, 陈家磊, 彭涵, 熊霞, 胡陈明, 杨礼, 宋小燕, 夏波, 余春林, 邱莫寒, 张增荣, 杜龙环, 汪江先, 熊柱翔, 杨朝武

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摘要

旨在研究鸡不同组织及骨骼肌卫星细胞中miR-133c-3p的表达情况，并利用生物信息学分析筛选其在胸肌中影响肌肉生长发育的关键靶基因。本研究利用在线网站预测鸡miR-133c-3p靶基因，进行GO和KEGG富集分析并构建蛋白-蛋白互作网络；利用在线公共数据库，分析胸肌相对于其他组织的miR-133c-3p表达量及筛选潜在靶基因，并通过双荧光素酶报告基因试验进行靶标验证。结果表明：1）预测获得103个靶基因；功能富集分析显示靶基因参与多种高分子化合物的合成与转运过程；并显著富集到肌动蛋白细胞骨架调控、mTOR等多条肌肉生长发育相关信号通路。2)PPI网络共筛选到5个Hub基因。3)miR-133c-3p仅在胸肌和心脏中表达，在胸肌中的表达量极显著高于心脏（P<0.01），且在卫星细胞增殖分化期间其表达水平呈先下降后上升的规律。4）共筛选到SGK1、MYH9、KLF7和NFAT5 4个靶基因。5）双荧光素酶报告基因检测发现miR-133c-3p与NFAT5存在靶标关系。综上，鸡miR-133c-3p在胸肌中可通过靶向NFAT5间接调控肌肉生长发育。本研究为解析鸡miR-133c-3p的功能及其分子机制提供了参考和依据。