冠心病相关长链非编码RNA uc004coz.1的生物学功能与序列分析

摘要

目的：初步了解冠心病相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)uc004coz.1的生物学功能并分析其基因序列信息。方法：通过对冠心病患者血浆测序结果中下调表达的lncRNA进行分析以及临床样本验证发现目标lncRNA uc004coz.1。在人脐静脉内皮细胞（human umbilical vein endothelial cell,HUVEC）中使用荧光原位杂交技术对uc004coz.1进行细胞定位，siRNA敲减uc004coz.1后分析其生物学功能，通过CCK-8、Transwell、EdU染色、流式细胞术、Western blot实验分析uc004coz.1敲减对细胞增殖和迁移的影响，并通过cDNA末端快速扩增（rapid-amplification of cDNA end,RACE）实验获得uc004coz.1的全长序列信息。结果：临床样本验证发现uc004coz.1在冠心病患者中表达下调。uc004coz.1主要定位在HUVEC细胞核，敲减后细胞的增殖迁移明显减弱，并且细胞周期相关蛋白Cyclin D1与Cyclin E1表达下调。通过与Ensembl数据库RNA序列和基因组进行比对，得到uc004coz.1对应的染色体为Homo sapiens mitochondrion,complete genome（序列编号：NC＿012920.1）。检索数据库发现uc004coz.1在此染色体中的位置为15 998～16 569。5′-RACE测序结果显示5′末端位置为16 033,3′-RACE测序结果显示3′-RACE末端位置为16 417。结论：了解冠心病患者血浆中下调的lncRNA uc004coz.1的生物学功能并分析其基因序列，能够为冠心病的机制研究提供一个靶点，也能够为uc004coz.1的深入研究提供理论基础。

关键词

冠心病 / 长链非编码RNA / uc004coz.1 / 细胞增殖 / 细胞迁移 / RACE实验