一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测

张虎, 毛春蓉, 练云, 庞洁, 吴红雁, 杜欣娜

南京医科大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (9) : 1217 -1226.

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一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测

    张虎, 毛春蓉, 练云, 庞洁, 吴红雁, 杜欣娜
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摘要

目的:构建一种新的预测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)预后和治疗的模型。方法:利用单因素分析以及最小绝对收缩和选择运算(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)-Cox回归分析训练队列GSE39582,构建CRC预后标签(prognostic signature of colorectal cancer,PSCRC),并利用外部队列CRC_TCGA和GSE17536验证PSCRC。评估PSCRC与临床指标、肿瘤免疫微环境和免疫细胞浸润的相关性,基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)PSCRC的潜在功能。整合PSCRC和临床分期等7个因素绘制预后列线图,并通过决策曲线分析(decision curve analysis,DCA)评估预后效果。最后,预测免疫治疗和化疗疗效。结果:本研究构建了PSCRC,2个外部队列证实其预后灵敏度和特异度较高。TNM分期均显著影响PSCRC风险评分(P均<0.001);PSCRC与肿瘤微环境基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分均显著正相关(P均<0.001),与中性粒细胞浸润显著正相关(P均<0.05),与活化记忆性CD4+T细胞浸润显著负相关(P均<0.01)。进一步地GSEA分析显示,PSCRC可能参与氧化磷酸化、血管新生、缺氧和炎症应答等过程。重要的是,新构建模型显示出较好的预后能力,C指数为0.765,95%置信区间为0.747~0.783(P <0.001)。最后,在3个队列中治疗预测均显示低风险评分组免疫治疗响应率更高(P均<0.001);PSCRC与伊马替尼、达沙替尼、帕唑帕尼等化疗药半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)显著负相关(P均<0.001),与二甲双胍、索拉非尼等药物IC50显著正相关(P均<0.001)。结论:本研究构建了PSCRC,为CRC预后提供了良好的模型,还为预测治疗提供了潜在标志物。

关键词

结直肠癌 / 预后模型 / LASSO-Cox回归 / 免疫治疗 / 化疗

Key words

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一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测[J]. 南京医科大学学报(自然科学版), 2024, 44(9): 1217-1226 DOI:

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