E-test与全基因组测序在食源性金黄色葡萄球菌耐药性检测中的性能评价研究

摘要

背景 食源性金黄色葡萄球菌对抗菌药物的耐药性日益严重，获取准确快速的药敏结果对临床治疗至关重要。目的 比较分析E-test法与全基因组测序（WGS）检测食源性金黄色葡萄球菌对临床重要抗菌药物耐药性的性能评价。方法 于2025年3—11月收集北京市朝阳区疾病预防控制中心与新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心开展的食源性疾病监测项目中的72株食源性金黄色葡萄球菌，以微量肉汤稀释法（BMD）为金标准，平行检测菌株对苯唑西林、万古霉素、达托霉素、利奈唑胺、利福平、环丙沙星、左氧氟沙星和莫西沙星共8种药物的耐药性，系统评估E-test法与WGS的诊断性能。结果 E-test法检测苯唑西林、利奈唑胺、利福平、左氧氟沙星及莫西沙星的灵敏度为80.0%～100.0%，特异度为94.4%～100.0%,Kappa值为0.86～1.00；对达托霉素和万古霉素的特异度均为100.0%；对环丙沙星的灵敏度、特异度和Kappa值分别为57.1%、100.0%和0.70。WGS分析显示，对mecA基因、利奈唑胺耐药相关23S rRNA G2576T突变及利福平耐药相关rpoB H481N突变等主要机制的识别与表型结果高度一致；对环丙沙星的灵敏度、特异度和Kappa值分别为100.0%、96.9%和0.85；对左氧氟沙星和莫西沙星则均分别为100.0%、88.4%和0.38。结论 E-test法在检测苯唑西林、利奈唑胺、利福平、左氧氟沙星和莫西沙星方面与金标准BMD法高度一致，适用于常规筛查；但存在高估达托霉素最低抑菌浓度（MIC）、漏检万古霉素中介耐药及对环丙沙星低水平耐药parC S80F突变灵敏度不足的局限。WGS在检测苯唑西林、利奈唑胺、利福平、达托霉素及万古霉素耐药方面表现可靠，可精准识别关键突变；但在预测喹诺酮类药物（环丙沙星、左氧氟沙星、莫西沙星）表型时需综合多位点突变分析。

关键词

金黄色葡萄球菌 / 耐药性检测 / E-test法 / 微量肉汤稀释法 / 全基因组测序

基金资助

首都卫生发展科研专项（首发2024-1G-4362）