宫颈癌预后相关铁死亡基因的筛选及其预后模型的构建

摘要

目的 筛选与宫颈癌预后相关的铁死亡基因并构建预后模型。方法 从FerrDb数据库获取铁死亡基因，从全基因组关联研究和肿瘤基因图谱数据库获取宫颈癌相关数据，进行全转录组关联研究、共定位分析和差异表达分析，筛选出与铁死亡相关的候选基因，并对基因进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。采用单因素Cox回归分析进一步筛选出与宫颈癌预后相关的基因；Kaplan-Meier法分析基因与患者总生存期的关系；通过TIMER数据库分析基因在泛癌中的表达水平。构建2个预后预测模型，模型1纳入年龄和肿瘤分期，模型2纳入年龄、肿瘤分期和预后相关基因，并比较2个模型的预测能力。结果 共获取91个与铁死亡相关的候选基因。单因素Cox回归分析显示15个基因与宫颈癌预后相关，CA9、SCD、TFRC、QSOX1和CDO1是影响宫颈癌患者预后的危险因素（P<0.05）,PTPN6、ALOXE3、HELLS、IFNG、MIOX、ALOX12B、DUOX1、ALOX15、AQP3和IDO1是保护因素（P<0.05）。15个基因的mRNA表达水平在至少7种癌症中表现出显著上升或下降，TFRC关联的癌症种类最多，为19种。Kaplan-Meier分析显示HELLS、DUOX1和ALOXE3与宫颈癌不良预后有关。模型1预测宫颈癌患者1年和3年总生存率的AUC分别为0.455和0.478，模型2的AUC分别为0.854和0.595，模型2(C-index=0.727)的预测能力优于模型1(C-index=0.502)。结论 基于生物信息学筛选出的15个预后相关基因组成的预后模型对宫颈癌患者的生存结局有较好的预测性能，为宫颈癌患者的预后评估提供重要参考价值。

关键词

宫颈癌 / 铁死亡基因 / 预后模型