小麦TaPBF3-5D的基因克隆及生物信息学分析

摘要

PBF因子是小麦胚乳特异基因表达调控蛋白因子之一，在调控小麦种子贮藏蛋白基因表达方面有着重要作用。本研究以小麦种质ZY96-3为材料，利用RT-PCR技术克隆获得TaPBF3-5D的CDS序列，对其进行了生物信息学和基因表达分析。结果表明，TaPBF3-5D基因CDS序列共有909 bp,编码302个氨基酸；其编码的蛋白为一个非跨膜的不稳定性亲水蛋白，无信号肽，共含36个磷酸位点；预测其定位于细胞核；通过系统进化树以及多重序列比对，TaPBF3-5D与来自于普通小麦中国春的PBF在亲缘性上更为接近。经荧光定量分析，TaPBF3-5D基因在根、茎、叶和籽粒中均有表达，以籽粒中表达最高，其次是叶和茎，根中表达最低。这进一步说明TaPBF3-5D基因参与调控小麦籽粒贮藏蛋白基因表达，调节籽粒发育。

关键词

ZY96-3 / TaPBF3-5D / 生物信息学 / 基因克隆