野生二粒小麦AP2家族基因鉴定与表达模式分析

摘要

AP2转录因子在植物信号转导、生长发育和胁迫响应方面发挥着重要作用。为探索AP2转录因子在野生二粒小麦中的分子特征，基于野生二粒小麦基因组信息，采用Blast和Hmmer进行AP2家族成员鉴定，对鉴定到的成员进行蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统进化树、保守结构域、基因扩增、顺式作用元件、密码子偏好性、表达模式和遗传多样性分析。结果表明，在野生二粒小麦中共鉴定到265个AP2基因，主要定位在细胞核和叶绿体中。根据系统进化树将其分为3个亚族，各亚族之间的保守结构域和基因结构存在保守性与多样性。AP2含有多个与生长发育和非生物胁迫相关的顺式作用元件。AP2基因的密码子偏好性可能受到压力选择作用。从AP2基因的表达模式看，该家族成员可能发生了亚功能化，且对盐胁迫响应有重要作用。通过对不同小麦群体中核酸多样性和分化指数分析，AP2基因部分成员在野生二粒小麦中具有较高的遗传多样性。

关键词

野生二粒小麦 / AP2基因 / 进化分析 / 表达模式 / 遗传多样性