小伞山羊草特异寡核苷酸探针开发和Oligo-FISH核型构建

摘要

小麦野生近缘物种小伞山羊草(Aegilops umbellulata,2n=2x=14,UU)是普通小麦的三级基因源。为准确鉴定小麦背景中的小伞山羊草染色体或染色体片段，本研究在利用二代测序获得小伞山羊草U基因组序列信息的基础上，根据其中鉴定出的17条可能的特异卫星重复序列设计了13个寡核苷酸探针。Oligo-FISH结果表明，其中10个探针可在小伞山羊草染色体上产生明显的杂交信号。对探针进行特异性分析发现，5个探针在小伞山羊草染色体上存在特异的杂交信号，在小麦染色体上则无信号，可作为识别小麦背景下U基因组染色体的特异性探针。本研究选择在小伞山羊草上能产生丰富信号的两个探针Oligo-pAu153、Oligo-pAu263与小伞山羊草特异探针Oligo-pAu133结合Oligo-pSc119.2构成探针套ONPS#AU1,用其构建了小伞山羊草染色体的Oligo-FISH核型。该FISH核型可以准确识别小伞山羊草各条染色体，对加快挖掘、转移和利用小伞山羊草优异基因具有重要意义。

关键词

小伞山羊草 / 二代测序 / 卫星重复序列 / 寡聚核苷酸探针 / 荧光原位杂交

基金资助

江苏省重点研发计划项目(BE2022346); 江苏省农业农村厅揭榜挂帅项目(JBGS[2021]006); 江苏省现代农业产业技术体系项目(JATS[2023]422)