ODC1基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达影响的初步观察与分析

摘要

目的 探讨鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)基因对前列腺癌细胞PC-3 LncRNA表达的影响，为进一步研究其作用及调控机制提供一些实验基础和线索。方法 以前列腺癌细胞PC-3作为研究对象，敲低ODC1基因，经q-PCR检测及WB检测验证后采用Illumina Novaseq 6000,PE150模式进行高通量测序，测序结果应用编码潜能分析方法(CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、LGC分析)进行预测筛选，对筛选出的lncRNAs行差异分析、顺式作用元件分析以及GO和KEGG富集分析。再选择文献报道中与前列腺癌关系密切的几个功能lncRNAs,采用q-PCR进行验证。结果 (1)在ODC1敲低PC-3细胞中筛选到341个lncRNA,差异表达的lncRNA中上调154个，下调128个。符合条件的差异lncRNA与差异表达基因共表达的顺式调控靶标有38个。(2)差异表达lncRNAs行GO和KEGG富集分析显示，lncRNA靶标基因参与体内多种生物学通路，如磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt信号通路)、Ras信号通路等，还与肿瘤血管生成、细胞群增殖、正调控细胞分裂等密切相关。(3)q-PCR法验证结果：LINC00973、TERC表达显著下调、LINC00638表达显著上调，与GO和KEGG富集分析得到的lncRNA差异表达情况一致。结论 敲低ODC1基因可导致PC-3细胞lncRNAs差异表达，ODC1基因有可能通过lncRNAs影响细胞信号通路，促进肿瘤的发生发展。本实验为进一步研究ODC1基因在前列腺癌中的作用提供了一些新的实验基础。

关键词

前列腺癌 / ODC1基因 / lncRNA / 差异表达

基金资助

新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2022D01C285)