新疆3个地区儿童头癣患者犬小孢子菌的群体遗传学研究

摘要

目的 研究新疆3个(和田、阿克苏及乌鲁木齐)地区儿童头癣患者犬小孢子菌菌株的遗传多样性水平以及菌种的种群结构。方法 收集2000年1月-2020年12月新疆3个地区的52株儿童头癣患者的犬小孢子菌菌株，基于微卫星方法，用Popgen软件分析观察等位基因数、有效等位基因数、香农信息指数、Nei氏基因多样性指数。采用GenAlEx软件进行分子方差变异分析和主坐标分析；采用NTSYS软件构建聚类图；采用STUCTURE软件分析犬小孢子菌的种群结构。结果 和田地区犬小孢子菌的观察等位基因数为2.091,有效等位基因数为1.878,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.307和0.596,阿克苏地区犬小孢子菌的观察等位基因数为2.182,有效等位基因数为1.503,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数为0.307和0.457,乌鲁木齐地区犬小孢子菌的观察等位基因数最高达到3.000,有效等位基因数为1.447,Nei氏基因多样性指数和Shannon信息指数分别为0.307和0.492。种群间遗传变异占4%,种群内遗传变异占96%。阿克苏地区犬小孢子菌和乌鲁木齐地区犬小孢子菌遗传距离最小，遗传相似度最大，亲缘关系较近，和田地区犬小孢子菌与阿克苏地区犬小孢子菌遗传距离最大，遗传相似度最小，新疆3个地区犬小孢子菌可被分为3个谱系。结论 新疆和田、阿克苏及乌鲁木齐3个地区的儿童头癣患者的犬小孢子菌具有遗传多样性。

关键词

犬小孢子菌 / 微卫星 / 遗传多样性 / 种群结构