基于生物信息学和实验验证研究探讨EI24在甲状腺癌诊断和预后中的价值

摘要

目的 利用生物信息学探讨依托泊苷诱导蛋白2.4(Etoposide-induced 2.4,EI24)在甲状腺癌(Thyroid cancer, THCA)中的诊断和预后价值并进行功能分析和体外实验验证。方法 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库和人类蛋白图谱(HPA)数据库分析EI24在THCA中的表达水平及其与临床特征的关系。采用Kaplan-Meier生存分析、Cox回归分析和受试者工作特征曲线(ROC)评价EI24对THCA的诊断及预后价值。通过基因富集分析(GSEA)探索可能的细胞机制和生物学功能，并利用蛋白互作数据库(STRING)探索EI24的互作蛋白。随后，本研究通过细胞转染、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、Western blot(WB)、CCK-8、克隆形成实验、Transwell实验、Oris细胞迁移实验等探讨EI24不同表达水平对THCA细胞功能的影响。结果 与正常甲状腺组织相比，THCA组织中EI24 mRNA及其蛋白水平均呈高表达，且与THCA患者的总生存期(Overall survival, OS)和无进展间期(Progress free interval, PFI)等均显著相关。ROC曲线分析表明，EI24在THCA中的曲线下面积(AUC)为0.900。较高的EI24 mRNA表达与预后不佳有明显相关关系，且M分期、病理阶段和EI24的表达状态是THCA患者PFI的独立危险因素。京都基因与基因组百科全书(KEGG)和GSEA的分析显示，EI24主要通过肿瘤蛋白p53(TP53)调控细胞周期基因和细胞死亡基因的转录、间质-上皮转化因子(MET)激活蛋白酪氨酸激酶2(PTK2)信号、MET信号等途径在THCA中发挥作用。体外实验证实，EI24高表达促进THCA细胞系的增殖、侵袭和迁移能力。结论 EI24在THCA组织中高表达，与THCA预后不良有关，EI24的过表达能促进THCA细胞的增殖、侵袭和迁移，提示EI24可作为THCA预后和诊断的生物标记物以及治疗潜在靶标。

关键词

甲状腺癌 / 生物信息学 / EI24 / 预后

基金资助

新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2023D01C96)