CSF1R在食管癌中免疫原性的筛选及鉴定

摘要

目的 筛选食管癌肿瘤免疫原性生物标志物，验证其免疫原性，探索食管癌候选基因相关免疫检查点分子及通路。方法 利用cBioPortal数据库中食管癌患者数据，通过预后分析及免疫浸润程度分析，筛选出食管癌相关突变基因中免疫原性突变基因-集落刺激因子1受体(Colony-stimulatingfactor1receptor, CSF1R)。分别用突变型及野生型CSF1R串联微基因多肽(Tandem micro gene, TMG)体外刺激活化外周血单核细胞(Peripheral blood mononuclear cells, PBMC),通过流式细胞术检测41BB和OX40验证CSF1R基因免疫原性。将PBMC与食管癌细胞共培养，观察PBMC杀伤食管癌细胞能力是否增强。进行食管癌与免疫检查点相关性分析，CSF1R关联免疫检查点和通路相关性分析，探索CSF1R调控食管癌免疫治疗的机制。结果 通过生信分析方法筛选出与食管癌预后相关且免疫浸润较高的基因CSF1R。通过流式细胞术检测PBMC中41BB与OX40表达量，CSF1R突变型较野生型增高(P<0.05)。活化的PBMC与食管癌细胞共培养后发现突变型TMG活化的PBMC杀伤癌细胞能力较野生型显著增高(P<0.05)。分析显示，CD80、CTLA4、TNFSF14、TNFSF9等差异表达免疫检查点与食管癌发病显著相关(P<0.05)。CTLA4、TNFRSF14、TNFRSF9等食管癌差异表达免疫检查点与CSF1R高度相关(P<0.05)。PIK3CD、FCGR3A、FGF2、PIK3R1、BTN2A2、PREX2、PRR5L、CD40等基因与CSF1R及PI3K/AKT信号通路具有高度相关性(P<0.05)。结论 CSF1R具有较好免疫原性，初步证明CSF1R参与PI3K/AKT信号通路调控食管癌的发生发展。

关键词

食管癌 / 免疫原性突变基因-集落刺激因子1受体 / 免疫原性 / PI3K/AKT信号通路