人源性尿酸降解菌Laticaseibacillus paracaseiM2a在高尿酸环境中的基因表达变化分析

摘要

目的 分析人源性尿酸降解益生菌(Laticaseibacillus paracasei M2a)在高尿酸环境中原核转录组的变化。方法 将Laticaseibacillus paracasei M2a菌株接种于高尿酸德式乳杆菌保加利亚亚种培养基(MRS培养基)的为高尿酸组，接种于普通无尿酸德式乳杆菌保加利亚亚种培养基(MRS培养基)的为正常组。将高尿酸组与正常组培养基在37℃温箱中厌氧环境下培养36～48 h,取培养出的Laticaseibacillus paracasei M2a菌株用核酸提取试剂盒提取菌体RNA,提取出的菌体RNA送上海美吉生物医药科技有限公司进行转录组测序，比较高尿酸组与正常组间Laticaseibacillus paracasei M2a菌株的差异表达基因。结果 原核转录组测序共获得3 017 804 bp个碱基，2 845个编码基因。编码基因经COG、GO及KEGG数据分析后主要功能分布于碳水化合物转运代谢、氨基酸的转运和代谢及催化活性等途径。差异表达基因分析中表达量大于1的基因有2 178个，其中共有基因2 096个，高尿酸组特有基因67个，正常组特有基因15个。高尿酸组较正常组Laticaseibacillus paracasei M2a菌株低表达基因数目为58,高表达基因数目为78,存在直接或间接与嘌呤核苷酸代谢相关的基因12个。结论 高尿酸组和正常组培养的Laticaseibacillus paracasei M2a菌株在原核转录组水平上基因表达存在差异。

关键词

人源性益生菌 / 原核转录组 / 类干酪乳酪杆菌 / 尿酸 / 降解菌