细粒棘球绦虫低密度脂蛋白受体相关蛋白生物信息学分析及其参与糖代谢的作用预测

摘要

目的 克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang, EgLRP-Xinjiang)的基因序列，并分析其生物学信息。方法 通过基因克隆技术获得EgLRP基因的全长序列，并利用生物信息学方法预测EgLRP蛋白的生理生化特征、信号肽、跨膜区域、蛋白结构、进化树以及蛋白互作关系等生物学信息。结果 基因克隆结果显示，EgLRP-Xinjiang与NCBI数据库中的EgLRP基因序列的相似性为99.84%。生物信息学分析结果显示，EgLRP的cDNA全长序列8 205 bp,编码2 734个氨基酸，存在1个信号肽和1个跨膜区域。EgLRP蛋白具有碳水化合物运输和代谢相关的超家族蛋白YvrE(YvrE super family)的特征结构域。进化树结果显示，EgLRP与多房棘球绦虫、微口膜绦虫的亲缘关系较近；与智人、小鼠等物种的亲缘关系较远。EgLRP蛋白与细粒棘球绦虫中的DVL-3、Intersectin-1和Wnt等蛋白存在相互作用，与mTOR、Wnt、Notch等信号通路密切相关。结论 本研究成功克隆出EgLRP基因，其编码蛋白具有糖代谢相关特征结构域，且与代谢相关信号通路之间存在关联，可能参与细粒棘球绦虫的糖代谢等能量代谢过程，为研发新型抗包虫病药物靶点提供了研究基础。

关键词

细粒棘球绦虫 / 低密度脂蛋白受体相关蛋白 / 生物信息学分析