ATP结合盒转运蛋白家族与膀胱癌免疫治疗效果的关联性分析

摘要

目的 基于IMvigor210和UNC-108(GSE176307)数据集分析探讨ATP结合盒(ABC)转运蛋白家族在膀胱癌患者免疫治疗中的临床应用价值。方法 从IMvigor210数据集下载348例接受免疫治疗的膀胱尿路上皮癌患者的基因表达数据，将患者基于ABC转运蛋白家族基因表达水平进行共识聚类，分为聚类1和聚类2进行生存分析。通过单因素Cox回归分析筛选出对预后有影响的ABC转运蛋白家族基因，使用随机生存森林算法构建ABC评分预测模型，用于预测患者的生存期及免疫治疗反应，利用UNC-108数据集进一步验证模型的准确性。最后，采用ESTIMATE、ssGSEA算法评估患者的肿瘤微环境情况、oncoPredict算法预测患者对化疗药物顺铂的敏感性。结果 筛选出9个ABC转运蛋白家族基因用于构建ABC评分预测模型。在IMvigor210队列中，Kaplan-Meier生存分析显示ABC评分低的患者总生存时间明显长于ABC评分高的患者(P<0.001);ABC评分模型对患者0.5年、1年和1.5年生存预测的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.80、0.87和0.88;ABC评分对免疫治疗效果的预测能力的AUC为0.78,高于肿瘤突变负荷(AUC:0.72)和程序性死亡受体配体1(AUC:0.58)。ABC评分在UNC-108验证队列中也有着良好的预测效果。ABC评分与肿瘤微环境、多种免疫细胞、免疫表型、免疫评分、免疫检查点基因表达情况显著相关。结论 ABC转运蛋白家族与膀胱癌的肿瘤微环境、免疫治疗效果关系密切，有望成为膀胱癌免疫治疗的新型生物标志物。

关键词

膀胱癌 / ATP结合盒转运蛋白 / 免疫治疗 / 肿瘤微环境 / 基因 / 预测模型 / 生存分析 / 顺铂

基金资助

国家自然科学基金项目(No.82072822)