基于生物信息学分析ADCY1基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

摘要

目的 通过生物信息学方法分析腺苷酸环化酶1(ADCY1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达水平、临床意义及预后价值。方法 基于UALCAN数据库获得数据分析ADCY1在ccRCC组织中的表达水平及与病理特征的相关性。通过GEPIA2数据库分析ADCY1在ccRCC中的预后价值。通过HPA数据库分析ADCY1的蛋白质表达水平和三维结构。基于Genecard数据库分析ADCY1的亚细胞定位。利用STRING数据库获得ADCY1相互作用蛋白，并使用R软件分析其功能富集。通过cBioPortal数据库分析ADCY1基因的突变情况。基于R语言分析ADCY1在ccRCC中的免疫细胞浸润情况。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)和免疫组织化学染色初步验证ADCY1在ccRCC临床组织样本中的表达水平。结果 ADCY1在ccRCC中表达降低，且与ccRCC病理分期、分级显著相关，ADCY1低表达的患者总生存率(OS)和无病生存率(RFS)低。ADCY1主要表达于细胞的质膜、细胞外、细胞核。ADCY1与吗啡成瘾、昼夜节律调节、多巴胺能突触、3′,5′-单磷酸腺苷(cAMP)信号通路密切相关。ADCY1在ccRCC中的主要突变类型为错义突变。ADCY1与ccRCC中的CD4 T细胞和巨噬细胞浸润呈正相关。验证实验结果显示，在ccRCC临床组织样本中ADCY1基因和蛋白表达相较于正常组织下降。结论 ADCY1可能是ccRCC的新预后标志物和潜在临床治疗靶点。

关键词

肾透明细胞癌 / 腺苷酸环化酶1 / 生物信息学分析 / 预后标志物 / 治疗靶点

基金资助

国家癌症中心重点课题项目(No.SZ2020ZD003); 山西省研究生教育创新项目(No.2023SJ142)