基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义

摘要

目的 研究前列腺癌组织特异性长链非编码RNA(lncRNA)表达及其临床意义。方法 利用生物信息学方法深入分析TCGA及GEO基因组数据库，对数据库收录的492例前列腺癌组织和152例癌旁组织做基因差异分析，筛选出差异表达的lncRNA,并进一步分析上述lncRNA的前列腺组织特异性及对前列腺癌患者预后的影响。结果 筛选出差异表达的5个lncRNA包括：前列腺相关转录因子14(PCAT14)、前列腺抗原3(PCA3)、C末端结合蛋白1-AS(CTBP1-AS)、DRAIC、GPC5-AS1。其中，PCAT14、PCA3在前列腺癌组织中特异性表达，二者升高提示与前列腺癌预后相关，且二者与激肽释放酶相关肽酶3(KLK3)、α-甲基酰基辅酶A消旋酶(AMACR)、溶质转运蛋白家族45A3(SLC45A3)等前列腺癌特异抗原相关性好。针对PCAT14、PCA3进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析提示：PCA3差异表达与吞噬作用、细胞识别、对细菌的防御反应、免疫球蛋白复合物、高尔基体、抗原结合、趋化因子受体结合、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等信号通路等密切相关；PCAT14差异表达与高尔基体、离子通道的活动相关通路，同时与肾素分泌、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、促性腺激素分泌相关信号通路等密切相关。结论 PCA3、PCAT14在前列腺癌组织中特异性表达，在正常组织中基本不表达，可以作为前列腺癌诊断的潜在指标。

关键词

前列腺癌 / 生物信息学 / lncRNA / 前列腺相关转录因子14 / 前列腺抗原3