基于转录组测序的胃癌关键基因识别与影响机制分析

摘要

目的：基于转录组测序（RNA-Seq）技术筛选胃癌（GC）进展关键基因，并推测其影响GC进展的潜在机制。方法：收集晚期GC腹膜转移患者行腹腔热灌注化疗（HIPEC）治疗前后大网膜转移结节进行高通量RNA测序，对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析；qRT-PCR检测上调倍数最大的前10个基因在治疗前后的mRNA变化；通过siRNA技术抑制HGC27细胞系中关键基因A1CF的表达，采用MTT实验、细胞克隆形成实验及Transwell实验检测A1CF对GC细胞增殖和侵袭能力的影响。结果：HIPEC后，共有2087个基因上调，875个基因下调。差异基因主要功能富集在MAPK通路、NOD样受体通路和TNF通路等。在上调倍数最大的10个基因中，治疗后FOSB、DEFA5、EGR3、A1CF的mRNA水平显著上升。细胞实验显示，抑制关键基因A1CF后GC细胞的增殖和侵袭能力明显减弱（P<0.05）。结论：FOSB、DEFA5、EGR3、A1CF是GC进展的关键基因，A1CF能够驱动GC细胞增殖与侵袭过程，促进GC进展。

关键词

胃肿瘤 / 腹腔热灌注化疗 / RNA测序 / A1CF