基于生物信息学方法分析NXPH4在肝细胞癌中的表达和临床意义及功能

摘要

目的：探讨神经外营养蛋白4(NXPH4)在肝细胞癌（HCC）中的表达及其临床意义和功能。方法：下载癌症基因图谱（TCGA）数据库中HCC的mRNA表达量和临床信息数据，比较NXPH4在HCC和癌旁组织之间的表达差异，分析NXPH4表达量与HCC病理及预后之间的关系。利用基因本体富集分析（GOEA）和基因集富集分析探究NXPH4在HCC中可能参与的生物学功能。结果：NXPH4在23种肿瘤中显著高表达，且与HCC患者TNM分期、组织学分级及血管侵犯等密切相关（P均<0.05）。预后分析显示NXPH4高表达患者总生存期较短（HR=1.64,95%CI:1.15～2.33,P=0.006）、疾病特异性生存率较低（HR=1.88,5%CI:1.19～2.96,P=0.007）；免疫浸润结果显示NXPH4表达与辅助型T细胞（Th）2、Th17显著相关（P均<0.05），与T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域（r=0.265,P<0.001）、程序性细胞死亡蛋白-1(r=0.297,P<0.001)、细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白-4(r=0.302,P<0.001)、淋巴细胞激活基因-3(r=0.179,P<0.001)的表达相关；基因富集分析显示NXPH4主要功能富集于模式指定过程（P<0.001）、受体配体活性（P<0.001）、胶原蛋白形成（P=0.009）、基质金属蛋白酶激活（P<0.001）、神经活性配体-受体相互作用（P<0.001）、ALK2通路（P=0.039）。结论：NXPH4与HCC患者临床病理分期和不良预后相关；NXPH4与促癌通路和免疫浸润相关，在预测患者预后和免疫治疗方面具有较高价值。

关键词

肝细胞癌 / 神经外营养蛋白 / 免疫浸润 / 临床预后 / 生物信息学