基于TCGA数据库分析CLDN9在胃癌中的预后价值及与免疫浸润的相关性

摘要

目的：分析连接蛋白CLDN9与胃癌预后的关系并进一步探索其与免疫浸润的相关性。方法：利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库获取胃癌的CLDN9基因表达量及相应的临床特征。通过Mann-Whitney U及Wilcoxon符号秩和检验分析胃癌组织与正常组织间CLDN9基因差异表达及其与临床特征的关系，进一步单因素、多因素Cox及Kaplan-Meier方法探索CLDN9与预后的相关性，利用ROC曲线获取最佳截断值。通过STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进一步行基因本体（GO）及京都基因百科全书和基因组（KEGG）的功能注释。通过肿瘤免疫估计资源分析CLDN9与免疫细胞浸润丰度的关系。结果：CLDN9基因在胃癌组织中表达上调，且男性CLDN9高表达，而G₃期胃癌组织中的CLDN9低表达（均P<0.05）。CLDN9基因高表达组总生存期（OS）明显小于低表达组（20.6个月比58.2个月，HR=1.694,95%CI:1.214～2.365,P=0.002），在各亚组中(年龄>65岁、T_1～2、N_1～3、M₀、Ⅲ～Ⅳ期、G₃、R₀残留肿瘤、无Barretts食管、无反流史、未抗反流治疗及无Hp感染)CLDN9高表达组OS都小于低表达组（均P<0.05）。CLDN9区分胃癌组织与正常组织的最佳截断值为0.426，其敏感度和特异度分别为78.1%和73.6%。通过GO及KEGG进行功能注释发现，CLDN9可能参与细胞紧密连接及细胞-细胞黏附信号通路。CLDN9表达与CD8⁺T细胞（r=-0.276）、中性粒细胞（r=-0.192）及树突状细胞（r=-0.213）的浸润丰度具有负相关性（P<0.001）。结论：CLDN9基因在胃癌中高表达，且高表达的CLDN9与免疫抑制及不良预后相关，可作为潜在预后预测指标及治疗靶点。

关键词

连接蛋白CLDN9 / 胃肿瘤 / 预后 / 免疫浸润