基于坏死性凋亡基因鉴定肝癌亚型并构建预后模型

摘要

目的：构建肝癌坏死性凋亡相关基因（NEGs）的预后风险模型并验证。方法：通过无监督聚类分析TCGA和ICGC数据库的肝癌患者的67个NEGs分群，并探讨不同集群间预后的差异。通过单因素Cox分析筛选出预后相关的基因，使用聚类和多因素Cox回归构建预后模型，并验证模型准确性和预测能力。结果：将67个NEGs分成2个亚型，包括NEGclusterA和NEGclusterB，生存分析显示NEGclusterB的预后优于NEGclusterA(P<0.05)。单因素Cox分析得到133个预后相关基因，并分为genecluster A和geneclusterB 2个亚型，genecluster A的预后优于genecluster B(P<0.001)。确定3个基因（SLC1A5、MYBL2和CFHR3）构建预后风险评分模型，在TCGA训练集和验证集中，高风险组患者的预后均较差（P<0.05）。结论：该预测模型可以独立预测肝癌的预后，并初步揭示不同肝癌集群间免疫细胞浸润的差异。

关键词

坏死性凋亡 / 肝肿瘤 / 预测模型 / TCGA

基金资助

福州市科技计划项目（2021-S-173）; 国家自然科学基金资助项目（81773055）; 福建省自然科学基金项目（2018J01829）