基于网络药理学与分子对接技术探究瑞马唑仑在结肠癌手术中的作用机制

摘要

利用网络药理学与分子对接技术探究瑞马唑仑在结肠癌手术的相关靶点及其作用机制。通过GeneCards数据库、TTD数据库和OMIM数据库获取结肠癌疾病靶点，DGIdb数据库、Drugbank数据库和Swiss Target Prediction数据库获取瑞马唑仑作用靶点。借助微生信在线平台分析获取药物对疾病的潜在靶点。于STRING数据库剔除无关靶点，导入Cytoscape软件，予以可视化处理，构建PPI网络，借助CytoNCA和Cytohubba插件筛选出前10位hub基因。GO和KEGG富集分析与可视化均通过R 4.2.1实现，“ClusterProfiler”包用于富集分析，“ggplot2”包进行结果可视化。通过AutoDock Vina验证靶点与化合物的结合活性，并利用PyMOL进行结果可视化。获取结肠癌相关疾病靶点7017个、瑞马唑仑潜在作用靶点122个。通过韦恩图分析交集靶点88个。构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络识别出核心靶点EGFR和CASP3。GO和KEGG富集分析显示，瑞马唑仑可能通过调控EGFR-酪氨酸激酶等多条通路影响结肠癌的发生与发展。分子对接分析表明瑞马唑仑与CASP3和EGFR的结合能分别为-4.76 kcal/mol和-5.22 kcal/mol，显示出良好的结合活性。瑞马唑仑可能通过作用于细胞凋亡、氧化应激、细胞代谢及炎性反应等生物学途径在结肠癌手术中发挥作用。

关键词

结肠癌 / 瑞马唑仑 / 网络药理学 / 分子对接技术