转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因

叶长春, 迟苗苗, 胡延昇, 李鸽, 孙学军, 孙祺

中国现代普通外科进展 ›› 2024, Vol. 27 ›› Issue (4) : 292 -297.

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转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因

    叶长春, 迟苗苗, 胡延昇, 李鸽, 孙学军, 孙祺
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摘要

目的:通过转录组测序技术(RNA-Seq)比较腹膜后脂肪肉瘤(RPL)组织与正常脂肪组织基因表达谱的差异,识别预后相关的关键基因并探究其潜在机制。方法:收集RPL患者肿瘤组织与瘤旁正常脂肪组织进行RNA-Seq并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析;基于TCGA数据库筛选预后相关的高风险基因并使用Kaplan-Meier曲线和受试者操作特征(ROC)曲线进行验证。结果:与正常脂肪组织相比,RPL组织中同时上调的基因共279个,主要富集在免疫反应过程和PPAR信号通路;结合TCGA数据集共鉴别出稳定的预后高风险基因7个,高风险组患者总生存率显著低于低风险组(P<0.05)。结论:KCNQ5、RBPJ等基因可能与RPL患者的不良预后相关,解析这些基因在RPL中的作用及机制有望为RPL患者诊疗策略的制定提供有力证据。

关键词

腹膜后肿瘤 / 转录组测序技术 / 差异表达基因 / 预后

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转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因[J]. 中国现代普通外科进展, 2024, 27(4): 292-297 DOI:

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