lncRNAs-REG轴调控结直肠腺瘤癌变的研究

摘要

目的：明确lncRNAs在结直肠腺瘤（CRA）向结直肠癌（CRC）进展过程中的表达谱及功能，筛选具有潜在调控作用的lncRNA及相关分子轴，寻找CRC癌前病变的风险评估指标及治疗靶点。方法：通过高通量RNA测序技术（RNA-seq）分析lncRNAs的表达谱，并基于miRanda算法构建lncRNA-mRNA互作网络，筛选具有潜在调控作用的基因。生物信息学技术预测差异表达lncRNA及mRNA的潜在功能，免疫组化半定量法检测REG家族基因的表达，实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证结果与RNA测序数据一致。Pearson相关性分析lncRNA与mRNA的表达关联。结果：共鉴定出461个CRA和CRC差异表达的lncRNAs，其中250个呈上调表达，211个呈下调表达。CRA中NONHSAT071873的表达上调最为显著。生物信息学技术对lncRNA及mRNA的潜在功能进行预测，发现NONHSAT071873可能作为ceRNA参与调控失调的REG3α表达。免疫组化半定量表达发现REG家族中REG3α在进展期CRA中上调最为显著。RT-qPCR验证结果与RNA-seq数据一致，显示NONHSAT071873及REG3α在CRA中均呈高表达。Pearson相关性分析证实，NONHSAT071873与REG3α表达呈显著正相关。结论：NONHSAT071873/REG3α轴可能是CRC癌前病变的评估风险指标及潜在治疗靶点。

关键词

结肠肿瘤 / 长链非编码RNA / 高通量RNA测序 / NONHSAT071873