基于miRNA-gene调控网络的miRNA重要性评估

摘要

MicroRNAs (miRNAs)是一类非编码短序列RNAs分子，它能够与靶基因特异性结合，进而影响靶基因对应的蛋白质产量。单个miRNA可能调节多个基因的表达，同时，单个基因的表达也可能被多个miRNAs所调控。已有研究表明，miRNA可以作为潜在的肿瘤标志物用于癌症的早期诊断和治疗。评价不同miRNAs的重要性对于探究miRNA在各种疾病中的作用具有重要的意义。因此，文章基于miRNA与基因之间的调控网络，提出了一种miRNA重要性评价指标。通过对该指标对miRNAs进行打分排序，排名靠前的miRNAs与疾病相关可能性越大，GO富集分析结果表明，排名靠前的miRNAs具有重要的生物学功能。基于排名靠前的100个miRNAs表达特征，训练SVM分类模型对各种癌症进行分类，实验证明其平均精度达到90%以上。总之，文章提出的miRNA重要性指标对于疾病相关miRNAs的识别以及应用具有重要的指导意义。

关键词

miRNA / 基因调控网络 / 基因 / 重要性评估

基金资助

国家自然科学基金资助项目(62002079); 广东省自然科学基金资助项目(2023A1515011401); 广州市科技局市校联合基金资助项目(SL2022A03J00935)