基于网络最短路径的miRNA对疾病异常细胞功能影响的量化方法

摘要

miRNA对凋亡、血管生成等细胞功能有关键调控作用，而癌症等复杂疾病的发生发展与细胞功能的异常密切相关。因此，确定miRNA对疾病异常细胞功能的影响，可以帮助理解疾病发生发展的相关机制、发现疾病治疗新靶点。尽管传统分子生物学实验能够验证miRNA与疾病异常细胞功能的关系，但其存在实验周期长、成本高昂等显著局限性。为了解决这个问题，文章通过计算差异表达的miRNA与功能基因之间的最短路径，提出一种量化miRNA对疾病异常细胞功能影响的方法，即SP-MFA。将SP-MFA分别应用于肺癌及结直肠癌数据集，可识别疾病异常功能相关的miRNA。经过文献检索、KEGG通路富集分析等方式分析得到的结果显示，SP-MFA可以有效地识别与疾病异常细胞功能相关的miRNA。

关键词

miRNA / 疾病 / 细胞功能 / 最短路径