单分子实时测序技术在1例21-羟化酶缺陷症患儿基因检测中的临床应用

摘要

目的 应用单分子实时测序(single molecular real-time sequencing, SMRT)技术明确1例21-羟化酶缺陷症患儿的分子病因，并探讨SMRT用于临床基因检测的可行性。方法 应用SMRT技术对先证者先天性肾上腺皮质增生症候选基因进行长读长测序，检测结果与多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)和Sanger测序检测的家系结果进行比较。结果 SMRT结果提示，先证者CYP21A2基因存在3个致病变异，先证者的一条染色体上串联排列两个重复的基因拷贝，分别为包含c.955C>T变异的CYP21A2基因和包含c.1069C>T变异的CYP21A2/CYP21A1P嵌合基因；另一染色体上的CYP21A2基因缺失。检测结果与家系MLPA+Sanger测序的结果相同，并明确了CYP21A2/CYP21A1P嵌合基因的排列方式。结论 SMRT技术能够明确基因拷贝数变异、结构变异及嵌合基因的排列方式，可为21-羟化酶缺陷症遗传学诊断和携带者筛查提供更有价值的信息，具有较大的临床应用前景。

关键词

单分子实时测序 / 长读长测序 / CYP21A2基因 / 嵌合基因 / 基因重复