剪接因子SF3B6通过调控基因表达促进乳腺癌细胞侵袭和迁移并影响患者预后

摘要

目的 探讨剪接因子3b亚基6(splicing factor 3b subunit 6,SF3B6)在乳腺癌中的表达特征、功能和潜在的作用机制。方法 使用TNMplot、UALCAN数据库分析SF3B6在乳腺癌的表达情况,使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析SF3B6的表达水平与乳腺癌患者预后的相关性。使用SF3B6的小干扰RNA(siRNA)转染至MDA-MB-231细胞对SF3B6进行沉默(siSF3B6),并通过CCK-8、Transwell、流式细胞术等实验检测干扰SF3B6的表达后对细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡的影响。分析TCGA和CPTAC数据库中乳腺癌患者的转录组和蛋白组数据,进一步解析SF3B6调控的下游靶标基因和功能。结果 综合TNMplot、UALCAN和Kaplan-Meier Plotter数据库的分析结果,SF3B6在乳腺癌肿瘤组织中表达显著高于癌旁组织(P<0.05),SF3B6的高表达与患者较差的无复发生存期显著正相关(P<0.000 1)。siSF3B6显著抑制了MDA-MB-231细胞的增殖、迁移和侵袭能力(P<0.05),并促进了细胞凋亡。TCGA乳腺癌中SF3B6高表达和低表达的RNA-seq数据分析结果显示,SF3B6的异常表达可显著改变基因表达谱,而且SF3B6诱导细胞因子互作、胃癌、肝细胞癌等通路基因的表达上调,包括CENPA、CCNE1、CDKN2A和CDCA3,后者显著影响乳腺癌患者预后(P<0.05)。结论 SF3B6在乳腺癌中高表达并起促癌作用,可作为乳腺癌潜在的生物标志物或治疗靶点。

关键词

剪接因子3b亚基6(SF3B6) / 乳腺癌 / 表达调控 / 转录组测序 / MDA-MB-231细胞

基金资助

宁夏自然科学基金资助(No.2022AAC03510)