食管癌组织ARL5B表达与临床病理特征的关系及作用机制

摘要

目的 应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制，并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法 从TCGA数据库下载食管癌数据集，R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组织标本，采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)验证ARL5B表达。免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系。利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析，qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因。结果 生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志。淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中，ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低，与生物信息学结果符合。临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关，其高表达是患者预后差的标志。富集分析显示ARL5B与囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有VPS16、KIF1A、TOM1等。qRT-PCR验证表明，VPS16、KIF1A、TOM1的mRNA在食管癌组织中表达高于癌旁组织(n=60)且与ARL5B表达呈正相关。结论 食管癌中ARL5B存在高表达，与肿瘤淋巴结转移、临床分期及预后有关；ARL5B可能通过多种分子机制调控参与食管癌进展。

关键词

食管癌 / ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B) / 临床病理学特征 / Kaplan-Meier法 / 生物信息学分析

基金资助

河北省科技厅卫生健康创新专项资助项目(No.21377785D)